バイオテクノロジー
ベスト5 ゲノムシーケンシング企業
ゲノムとマルチオミクスの革命
最初のヒトゲノム解読は1990年に開始され、2003年に初めて達成されました。その費用は驚異の30億ドルでした。
20年が経ち、ゲノムシーケンシングのコストは 1ゲノムあたり600ドルにまで下がりました。コストは5,000,000倍に削減されたことになります！さらに200ドル程度まで下がる可能性があります。
この変化は医療の観点からゲノミクスへのアプローチを根本的に変えました。膨大なデータが生成・解析できるようになり、各個人が自分固有の遺伝子構成に合わせた高度なパーソナライズド医療にアクセスできる可能性が生まれました。
ゲノミクスが基本的な医療インフラとなることで、ゲノムシーケンシング企業は急速に拡大する市場と、栄養・老化予防から早期がん検出まで多様な用途から恩恵を受けるでしょう。
そしてそれだけではありません。ゲノムDNAのシーケンシングに使用された同じ技術は、全く新しい科学分野を創出することも可能です:
- メタゲノミクス: 腸内に住む細菌のゲノムをシーケンスし、健康に大きく影響します。
- トランスクリプトーム & エピゲノミクス: ゲノムが設計図なら、トランスクリプトームはその設計図が実際にどのように使われているかをリアルタイムで示すものです。これは多くの不治の病や代謝問題の解決に非常に重要になるでしょう。
- アグリゲノミクス: ゲノミクスを活用して農業収量や家畜の生産性を向上させます。
- 生態学的研究: 生態系の健康状態と 遺伝的多様性を正確に評価します。
- 合成生物学: 特定の目的を持つ新しい遺伝子、形質、あるいは全く新しい生物体を創造します: 例として、プラスチックを分解するバクテリアやバイオ燃料を生成する藻類があります。
出典: PacBio
ベスト5 ゲノムシーケンシング企業 / 株式
この記事では、上場しているベスト5のゲノムシーケンシング企業を取り上げます。Ultima Genomicsや中国のMGIのような非上場の同等に重要な企業は対象外です。
1. Illumina, Inc.
(ILMN )
Illuminaは業界で圧倒的に最大かつ最も確立されたゲノミクス企業で、売上は12億ドル、過去5年間で年平均成長率11％を記録しています。
出典: Illumina
ほとんどのゲノムシーケンシング企業と同様に、Illuminaはシーケンサー本体の販売だけでなく、シーケンサーで使用される消耗品の販売で収益を上げています。機器1台あたりの売上は、使用率がフルタイムに近づくにつれて時間とともに増加する傾向があります。
同社の新しいゲノムシーケンサー「NovaSeqX」は好調で、2023年第2四半期に109台出荷、2023年通年で390台出荷が見込まれています。これにより、Illuminaの顧客はマルチオミクス解析（複数の「-omics」手法を組み合わせる）や単一細胞・空間解析の大規模化が加速しています。
Illuminaについて語る際には、血液サンプルからがんを検出する新しいゲノミクス応用「リキッドバイオプシー」についての長い説明が必要です。Illuminaはこの技術を開発し、後にGrailという会社としてスピンオフしました。
Grailは技術的・商業的に非常に成功しており、2023年第2四半期には7,500の医療機関がGrailの検査を処方し、10万件の検査実施マイルストーンを突破しました。また、6種類の血液がんに対して再発率を92％検出しています。
数年後、Illuminaははるかに高額な価格でこの会社を再取得しようとしました。
この再取得は複数の問題を引き起こしました。まず、米国とEUの規制当局が独占リスクを懸念し、IlluminaがGrailの競合他社にもシーケンサーを供給していることが問題視されました。
結果としてEUから4億3200万ユーロの罰金が科されました。もしこの取得禁止の裁定が解決されない場合、IlluminaはEU裁判所での挑戦に勝てなければ1年以内にGrailを売却することになる。
出典: Illumina
さらに、コストのかかるGrailのスピンオフ条件、資金調達、再吸収に関する問題が浮上しました。
活動家投資家カール・アイカーンが同社の取締役会を攻撃し、内部者に有利な不正または悪意のある取引が行われた可能性を示唆しています。SECもこの点を調査中です。
これまでにCEOが交代し、取締役が1名退任、4名の新取締役が就任しました。またIlluminaは「Stewardship-Focused Update」を公表しています。これらの疑惑や非難についてはNon-GAAP投資の一連の記事でも読むことができます。
同社の株価は2021年7月の高値から約80％下落し、2013年レベルに戻っています。
Illuminaのような大手で確立された企業にとって、これは非常に衝撃的な状況です。指摘された問題が真実であるかどうかに関わらず、Grailの売却決定自体が経営判断として評価を下げる要因となっています。少なくとも、これは高コストの失策であることが証明されました。
投資家は、伝説的かつ物議を醸す活動家投資家カール・アイカーンに同行する準備ができているか、そして過去数年のガバナンス問題がすでに株価に織り込まれているか、あるいは企業価値を過度に損なっているかを評価したいでしょう。
2. 10x Genomics, Inc.
(TXG )
10x Genomicsは空間生物学のリーダーで、ゲノムとトランスクリプトームを3次元で解析し、細胞レベル、さらには細胞内部レベルで遺伝子の活動を可視化します。
同社は2012年に設立され、創業者の一人であるSerge Saxonovはパーソナライズドゲノム検査会社23andMeのR&Dディレクターでもありました。
10x Genomicsは、10億ドル超のR&D投資と買収を組み合わせて成長しました。特に、2018年にSpatial Transcriptomicsを買収して得たVisiumプラットフォームが重要です。
出典: 10x Genomics: 10x Genomics acquisitions timeline
このようにして10x Genomicsは2020年にReadcoorとCartanaを買収し、Xeniumプラットフォームを取得しました。
2020年にはChromiumプラットフォームを立ち上げ、翌年にChromium Xへとアップデートしました。
2021年のTetramer Shop買収により、2022年にBEAM（Barcode Enabled Antigen Mapping）を開始しました。これにより研究者は免疫系の構成要素を詳細に特定でき、免疫や新興疾患の研究に大きなインパクトを与える可能性があります。
2023年第2四半期の売上は前年同期比17％増加し、Xeniumの販売が牽引し、2023年8月に100台販売のマイルストーンを突破しました。
同社は2023年9月に主要競合であるNanostringに対して重要な勝利を収めました。Nanostringは欧州の大部分でCosMx Spatial Molecular Imager（SMI）機器の販売が特許侵害として禁止されました。
10xはまだ初期段階にあり、Illuminaの初期とやや似ています。現在、空間生物学は学術・基礎研究の領域にとどまっていますが、多くのバイオテクノロジーと同様に将来的には医療ツールとして広く普及し、やがて「日常的」な検査になる可能性があります。導入機器が増えることで消耗品の売上と収益成長が促進されるでしょう。
3. Oxford Nanopore Technologies plc (ONT.L)
Oxford Nanoporeはフローベセルを利用した独自のゲノムシーケンシング技術を採用しています。この技術では、ナノポアを通過するDNAを化学的にではなく、電流の変化を測定することで「読み取ります」。つまり、コンピュータがリアルタイムで遺伝子配列（DNA・RNA）を読み取る初めてのケースです。
出典: Oxford Nanopore
同社技術のもう一つの独自性は、従来のシーケンシング手法よりも長い遺伝子配列を読み取れる点です。長い配列とリアルタイム読取は、がん解析や抗生物質耐性菌など感染症の診断において、より迅速かつ正確な結果をもたらします。
さらに電気測定により、従来の大型装置に代わる小型・携帯型シーケンサーが実現可能です。これにより、1,000ドルから始められる低価格・小型機器のラインナップが拡充し、モバイルや低コストシーケンシングという新たな市場が開かれます。
Oxford Nanoporeの売上は過去4年間で年平均成長率46％を記録し、2023年第2四半期には7,300の顧客が利用しており、そのうち640は過去12か月で新規獲得です。
出典: Oxford Nanopore
画期的な技術ゆえに、Oxfordが成熟したゲノムシーケンシングエコシステムの中でどの位置を占めるかはまだ不透明です。
化学・光学的なゲノム読み取り技術を完全に置き換える可能性があります。
あるいは、低ボリュームやモバイルシーケンシング、長い遺伝子配列の高精度読取が必要なニッチな用途に特化した成功例になるかもしれません。
同社はさらに、タンパク質や翻訳後修飾、低分子の読み取り、さらには生命科学の最前線に位置する測定領域への拡大も計画しています。
4. Pacific Biosciences of California, Inc.
(PACB )
Illuminaの数年後に設立されたPacBioは、規模は小さいものの、機器の性能はトップクラスを維持しています。
PacBioは2021年にOmniomeを取得し、極めて長いまたは短い遺伝子配列の読み取り精度を向上させました。この優位性は、2023年8月にAptonを1億1,000万ドルで買収したことでも強化されました（詳細はこちら）。
出典: PacBio
PacBioのOnsoシステムは現在顧客への出荷が開始され、同社は「PacBio史上最高のスタート」と評価しています。Onsoは短配列に特化し、Revio HiFiシステムは長配列を24時間365日で読み取り、年間1,300本（約1日4本）のヒトゲノムを解析可能です。将来的にはRevio HiFiはHT SBBシステムに置き換えられ、Apton技術が統合される見込みです。
PacBioは長配列市場がNGS全体よりもはるかに速く成長すると予測し、競合他社の10倍の精度を主張しています。
出典: PacBio
興味深いことに、総コスト削減にも寄与する可能性があります。短配列は全体を組み立てる必要があり、診断ツールとして実用化するには追加で約1,000ドルの解析が必要になることがあります。
一方、950ドルのRevio長配列解析は高精度であるため、追加解析が不要となり、診断用途ではより安価に提供できます。
PacBioは高精度・長配列解析に注力しており、今後数年間は診断分野での優位性を保つと見込んでいます。経営陣はヒトゲノミクス市場でのシェアを5％から10％、がん領域でのシェアを1％から5％に拡大できると考えています。
Illuminaとの長年の競争に加えて、診断・長配列市場ではOxford Nanoporeとの競合も意識しなければなりません。
Illuminaの小さな競合として歴史的に位置づけられるPacBioは、スタートアップ的な「エキサイティング」企業ではありませんが、ニッチ市場での成功が実現すれば、歴史的ライバルとの差別化で市場を驚かせる可能性があります。
5. NanoString Technologies, Inc.
(NSTG )
NanoStringは2003年にシアトルのシステム生物学研究所で開発されたデジタル分子バーコード技術を活用して設立されました。
出典: NanoString
2008年までに同社は最初の製品nCounterを発売し、トランスクリプトミクス（mRNA研究）に大きな進歩をもたらしました。nCounterはその後の製品開発の基盤となり、2019年にGeoMx、続いてCosMx、そしてデジタルプラットフォームAtoMXを展開しました。
GeoMxは組織全体のRNA発現を解析でき、150種以上のタンパク質も同時に測定可能で、10xのXeniumを上回るターゲット数を提供します。CosMxシングル分子イメージャ（SMI）は単一細胞レベルでRNAと最大64種（2024年には120種まで） のタンパク質を同時に観察できます。
出典: NanoString
NanoStringは空間生物学の科学出版物の急増に大きく貢献しました。7,117件以上の論文がNanoString機器を使用した研究（がん、感染症（COVID-19含む）、免疫学、農業、神経学など）を挙げています。
NanoStringは10x Genomicsと激しい法的闘争を続けています。EU特許規制当局による最近の裁定は、同社が控訴に敗れた場合、売上の10％に影響を及ぼす可能性があります。致命的な打撃ではありませんが、キャッシュフローがマイナスの若い企業にとっては厳しいニュースです。
市場はNanoStringの長期的な存続可能性に懸念を示しており、株価は1株あたり2ドル以下に低下し、2021年の最高値79ドルから大幅に下落しています。IPO時の価格は2013年に1株9.1ドルでした。
投資家は2025年に黒字化を達成する計画を評価し、2023年第3四半期にキャッシュバーンを50％削減したことを踏まえて、株価下落が過剰であり投資機会となるかどうかを判断したいと考えるでしょう。
