Tempus xR RNAシーケンシング検査、EU IVDRクラスC認証を取得

Tempus AI (TEM ) Tempus AIは、2026年10月26日の発表で、同社のxR RNAシーケンシング検査が、欧州連合の体外診断用医療機器規則に基づき、クラスCの体外診断用医療機器として認証を取得したと発表した。シカゴに本社を置く同社によると、この認証は「がんゲノムプロファイリングを通じて臨床管理を支援する次世代シーケンシング機器」に関する品質マネジメントシステムを対象としている。

xRは、固形腫瘍組織から遺伝子再構成と特定のスプライスバリアントを検出し、臨床管理を支援する。Tempusによると、IVDR認証により、適格なクラスC旧制度機器の移行期限である2028年以降も、EUでxRを継続して利用できる。また、バイオ医薬品企業のパートナーに、臨床試験を支援するIVDR認証済みの検査プラットフォームを提供できる。

IVDRの移行枠組み

発表で言及された2028年の期限は、2024年6月13日に欧州議会および理事会が採択し、2024年7月9日に欧州連合官報に掲載された規則2024/1860に由来する。同規則はIVDRである規則2017/746を改正し、一部の体外診断用医療機器に適用される移行期間を延長した。

改正後の第110条に基づき、指令98/79/ECに基づく適合性評価手続きで認証機関の関与が必要とされず、2022年5月26日より前に適合宣言が作成された機器は、市場への上市または使用開始が認められる期限が、クラスD機器では2027年12月31日、クラスC機器では2028年12月31日、クラスB機器および滅菌状態で上市されるクラスA機器では2029年12月31日となる。

この延長には条件が付されている。対象機器は引き続き指令98/79/ECに適合し、設計および意図する目的に重大な変更がなく、患者、使用者、その他の人々の健康または安全に許容できないリスクをもたらしてはならない。製造業者は、2025年5月26日までに第10条第8項に準拠した品質マネジメントシステムを導入している必要があった。クラスC機器については、2026年5月26日までに認証機関へ正式な申請を提出し、2026年9月26日までに書面による合意を締結する必要があった。

同規則の前文では、適合性評価が必要な多数の体外診断用医療機器を確実に認証するには、認証機関全体の処理能力が依然として不足していると指摘している。また、従来の移行期限である2025年5月26日までに、特に最もリスクの高いクラスD機器で供給不足が生じるおそれがあると警告していた。

検査の設計と引用された臨床エビデンス

Tempusの製品資料によると、xR IVDはFDAの認可を受けた定性次世代シーケンシングベースの体外診断用医療機器である。標的型のハイスループット・ハイブリダイゼーションキャプチャ技術を用い、固形悪性腫瘍と診断された患者のホルマリン固定パラフィン包埋腫瘍組織検体から分離したRNAを対象に、BRAFおよびRETの遺伝子再構成を検出する。

この検査はIllumina NovaSeq 6000プラットフォームで実施し、重複除去後のユニークリード数は600万に設定されている。固形悪性腫瘍と診断された患者のFFPEブロックまたは未染色スライドを受け付け、腫瘍含有率20％を必要とする。この基準を下回る場合は、マイクロダイセクションを実施できる。

同社によると、Tempusのシカゴ検査室で、この検査法は外部検証済みの直交的な次世代シーケンシング法と比較して、BRAF再構成に対する陽性一致率および陰性一致率がそれぞれ92.3％、100.0％、RET再構成に対してはいずれも100.0％を示した。資料によると、xR IVDの結果は、腫瘍学の専門家向け指針に従って、資格を有する医療従事者が使用することを想定している。また、特定の治療製品について、表示された用途を処方するものでも、決定的な判断を示すものでもない。

この発表では、RNA検査とDNA検査を組み合わせることで、DNA検査単独と比べて臨床的に有用な遺伝子融合の検出率が高まることを示したとTempusが述べる公表済みの研究を紹介している。2022年のASCOで発表され、2022年5月26日に公開されたこの研究では、Tempus xT検査を受けた患者77,400人の匿名化データセットを後ろ向きに分析した。このデータセットには約80,000件の検体が含まれていた。Tempus xT検査は、21遺伝子の融合検出を伴うDNAシーケンシングと、全エクソームキャプチャRNAシーケンシングを組み合わせている。研究者らはOncoKBを用いて、レベル1および2の融合変異と、適応症に合致する標的治療薬がある融合変異を特定した。

著者らは、1,945人の患者と20種類のがんで、レベル1および2の融合イベントを2,118件特定した。検体で最も多かったのは非小細胞肺がん（25％）と胆道がん（9％）だった。2,118件のうち、RNAシーケンシングのみで検出されたものは29.1％（616件）、DNAシーケンシングのみで特定できたものは4.8％（101件）だった。低悪性度神経膠腫では、融合の69.4％がRNAシーケンシングのみで検出され、肉腫ではその割合は58.2％だった。

OncoKBで適応症に合致する治療薬による治療標的となり得ると分類された融合遺伝子1,106件のうち、RNAシーケンシングのみで特定できたものは19%（214件）、DNAシーケンシングのみで特定できたものは5%（54件）、両方で特定できたものは76%（838件）だった。著者らによると、RNAシーケンシングのみで特定された融合遺伝子により、適合する治療薬の投与対象となる患者数は24%増加した（892人中214人）。これには、CML/BLCL患者に対するイマチニブ（69.8%）、非小細胞肺がん患者に対するクリゾチニブ（40.3%）、NTRKおよびROS1融合遺伝子に対するエヌトレクチニブ（32.5%）が含まれる。著者らは、DNAシーケンシングにRNAシーケンシングを加えることで、融合遺伝子の検出率と、患者に適合する標的治療薬を選択する能力が大幅に向上したと結論づけた。この結果は、標準診療における融合遺伝子の検出に、RNAとDNAのシーケンシングを組み合わせることを検討する根拠となる。

「xRについて欧州のIVDR認証を取得したことは、世界最高水準の規制基準を満たすという当社の取り組みをさらに強化するものです」と、Tempusの対外業務担当上級副社長、Lauren Silvis氏は述べた。「今回の成果により、欧州における強固な規制基盤が確立されました。当社はこの地域の医療従事者、バイオ医薬品パートナー、がん患者に向けて、高度なRNAシーケンシングツールの利用機会を広げるべく取り組んでいます。」

Tempusは、医療分野で人工知能を実用化し、精密医療の発展を推進するテクノロジー企業だと自らを説明している。同社によれば、世界最大級のマルチモーダルデータライブラリの一つと、そのデータを利用しやすく有用なものにするオペレーティングシステムを備えている。同社は、患者一人ひとりに合わせたケアを医師が提供できるよう、AIを活用した精密医療ソリューションを提供するとともに、治療薬の発見、開発、提供も支援しているという。