Biologie spatiale : Nanostring contre 10x Genomics

Encore quelques nouvelles frontières en biologie

Dans les articles précédents, nous avons abordé l’essor du séquençage de nouvelle génération (NGS) et son potentiel à révolutionner la médecine. La biotechnologie et la médecine deviennent chaque jour plus précises grâce à des outils moins chers pour séquencer l’ADN, exploiter l’ARN et synthétiser des protéines. Les créateurs de ces outils ont été présentés dans « Illumina vs Pacific Bioscience: Choosing the Next Generation Genome Sequencing Company ».

Il reste néanmoins certaines données manquantes. Des outils comme les séquenceurs NGS agrègent encore les données provenant de milliers voire de millions de cellules simultanément. Mais les chercheurs ont souvent besoin de déterminer ce qui se passe dans une seule cellule à la fois, avec une précision au niveau du nanomètre.

Cela devient désormais possible grâce à l’émergence d’un nouveau domaine scientifique: la biologie spatiale.

Biologie spatiale

Au lieu d’examiner le « mélange » de molécules dans un échantillon, la biologie spatiale peut déterminer où, dans un tissu ou une cellule unique, se trouve une molécule d’intérêt, comme une séquence spécifique d’ARN. Et cela peut être en 2D ou en 3D.

Cela indiquera aux chercheurs comment les cellules interagissent entre elles, comment les mécanismes de défense s’activent, comment une cellule réagit au contact d’un virus, et bien plus encore.

Cela présente également l’avantage de fournir des données beaucoup plus sensibles. Alors que les données provenant de quelques seules cellules pourraient se perdre dans un échantillon plus grand, l’approche ciblée de la biologie spatiale peut révéler les rôles clés de phénomènes localisés ou de types cellulaires rares.

Vous pouvez lire plus en détail les avantages uniques de la biologie spatiale dans cette FAQ de Nanostring.

Source: Yahoo Finance

Le potentiel d’investissement de la biologie spatiale

Dans les années 2000, le séquençage du génome a déclenché une révolution qui se traduit aujourd’hui par des thérapies géniques, l’édition de gènes, des vaccins à ARNm, etc., dans les années 2020. Cela a fait passer le cours de l’action Illumina de 16 $ lors de son introduction en bourse au début des années 2000 à 495 $ en 2021 à son pic (et reste entre 190 $ et 220 $ depuis).

En 2020, Nature Methods branded spatial transcriptomics “method of the year”.

Il est possible que les premières machines dédiées à la biologie spatiale de notre époque soient perçues comme le stade précoce d’une autre révolution qui s’imposera pleinement d’ici la fin des années 2030. Il est généralement avantageux d’être précoce avec une nouvelle technologie.

C’est également un moyen pour les startups et les innovateurs de dépasser les concurrents établis. Il peut être très difficile de battre une entreprise de 35 milliards de dollars comme Illumina sur son propre terrain, le NGS. Mais le terrain de jeu est plus équitable pour les nouvelles techniques où le grand concurrent ne détient aucun brevet clé, comme la biologie spatiale.

Certaines estimations placent le marché total adressable de la biologie spatiale à 16 milliards de dollars, la plupart des recherches en génétique et biologie moléculaire étant encore réalisées avec des technologies plus anciennes et moins puissantes.

Source: Nanostring