5 meilleures entreprises de microbiome (juillet 2026)

L’importance des microbiomes

Les microbiomes sont la communauté de bactéries présentes dans un environnement. Ils comprennent généralement des centaines, voire des milliers, d’espèces différentes qui interagissent entre elles de manière complexe.

Le plus souvent, lorsque l’on parle de microbiomes, on fait référence au microbiome intestinal humain. Il est essentiel à notre santé et peut être à l’origine de multiples problèmes médicaux, allant d’un simple inconfort à des affections potentiellement mortelles. Cela est particulièrement pertinent pour les maladies métaboliques et inflammatoires.

Mais il peut également s’agir du microbiome du sol, un composant essentiel de la fertilité du sol et des rendements agricoles.

En 2021, les entreprises de microbiome ont collectivement levé 1,6 milliard de dollars de capitaux en seulement 2 ans, principalement provenant de fonds de capital-risque.

La force des entreprises de microbiome réside dans l’exploitation d’organismes vivants qui contribuent déjà à la bonne santé d’une personne. Elles travaillent donc principalement avec quelque chose qui se dirige naturellement vers une utilisation thérapeutique.

Le problème est que les organismes vivants sont très complexes et peuvent être difficiles à contrôler ou à optimiser pour fournir un effet sanitaire prévisible et constant. C’est pourquoi le secteur ne peut être utilisé comme thérapeutique que maintenant, grâce aux progrès de la science génomique qui permettent aux chercheurs d’effectuer une analyse complète du génome du microbiome au cours des dix dernières années.

Sélection des 5 meilleures entreprises de biologie du microbiome

Ce top 5 a été créé pour mettre en avant les entreprises répondant aux critères ci-dessous.

(Il ne s’agit pas d’un conseil en investissement. L’ordre est basé sur la valorisation et peut ne pas refléter la qualité relative des entreprises.)

• Cotées en bourse.
• Actives exclusivement ou principalement sur le microbiome, ce qui exclut les grandes entreprises actives dans le domaine mais sans focus central sur le sujet.
• Possèdent un bon historique d’innovation dans le domaine.
• Un bon historique de développement de produits réussis, soit déjà commercialisés/licenciés, soit soutenus par des partenaires réputés.
• Des attentes raisonnables quant à la capacité de commercialiser un produit à partir de leurs efforts actuels de R&D.

(Une exception a été faite pour Finch Therapeutics en raison de la valeur potentielle de son portefeuille préclinique et de son important solde de trésorerie).

1. Finch Therapeutics

Valorisation: $22M

FNCH Graphique du prix

Dans une grande déception, l’entreprise a décidé en janvier 2023 d’interrompre son essai clinique de phase III pour les infections à C. difficile. Elle se concentrera plutôt sur le développement de traitements pour la colite ulcéreuse, la maladie de Crohn et l’autisme. Tous sont au stade préclinique.À ce stade, l’entreprise semble essentiellement en pause et pourrait constituer une bonne cible pour l’acquisition de son portefeuille préclinique. Ainsi, la valorisation actuelle repose principalement sur la valeur de cette propriété intellectuelle et des actifs du bilan.

L’entreprise dispose de 133 M$ de liquidités et équivalents, avec seulement 23 M$ de passif total. Cette valeur nette d’actif est bien inférieure à la capitalisation boursière actuelle, ouvrant la possibilité d’une liquidation « rentable » plutôt que d’une acquisition.

2. Synlogic

Valorisation: $57M

L’entreprise combine la biologie synthétique avec la science du microbiome. L’idée est de concevoir des bactéries capables d’exécuter une fonction spécifique dans le microbiome du patient.

L’entreprise travaille en tandem avec Ginkgo Bioworks (DNA ), que nous avons également couverte dans l’article sur la biologie synthétique, grâce à une collaboration de recherche stratégique de 30 M$. Synlogic conservera pleinement les droits de commercialisation.

Un autre partenariat a été signé en 2021 avec Roche pour développer un traitement contre la maladie inflammatoire de l’intestin (MII).

Synlogic se prépare à lancer l’essai clinique de phase III d’un médicament ciblant la phénylcétonurie (PCU), une maladie rare touchant 150 000 personnes dans le monde, dont 75 % des patients ne sont pas traités. Le potentiel de revenus du médicament est de 1 M$.

Elle possède également des études de phase I pour deux autres maladies, actuellement en phase II, ainsi que trois autres médicaments au stade préclinique.

L’entreprise est pré-revenus, disposant de 91 M$ de liquidités en septembre 2022 avec des dépenses de 18 M$ par trimestre, ce qui lui confère une trésorerie suffisante jusqu’au second semestre 2024.

3. Maat Pharma

Valorisation: $86M

Maat a développé des thérapies d’écosystème du microbiome (MET) en utilisant une analyse pilotée par l’IA. L’idée est de ne pas délivrer une seule espèce bactérienne au microbiome du patient, mais un écosystème complet de centaines d’espèces provenant de personnes saines et optimisé par l’entreprise.

L’objectif de la thérapie est d’atténuer les effets secondaires mortels des traitements contre le cancer. Elle compte actuellement trois produits en développement et quatre essais cliniques en cours en oncologie. Cela fait de l’entreprise la première à atteindre un essai de phase III pour un traitement microbiome en oncologie.

Un traitement est déjà en phase III et bénéficie de la précieuse désignation de médicament orphelin par la FDA, et un autre est en phase II.

Les résultats du médicament en phase III, MaaT013, sont prometteurs, augmentant considérablement le taux de survie des patients après un an, passant de 13 % à 44 % pour la moitié des patients traités qui ont montré une réponse positive. Le profil de sécurité était également bon, offrant de bonnes chances que le traitement soit utilisé chez la plupart des patients s’il est approuvé. Si tout se passe bien, le lancement de MaaT013 est prévu pour le début de 2025.

L’entreprise construit actuellement la plus grande installation d’Europe pour les MET, avec jusqu’à 9 000 capsules de MaaT013 par an et jusqu’à 1,6 million de capsules pour ses autres traitements encore en essai. Cela pourrait couvrir l’ensemble du marché adressable.

L’entreprise est cotée à la Bourse Euronext Paris. Elle est pré-revenus, dispose de 47 M$ de liquidités et a utilisé 10 M$ au dernier trimestre. Elle a également levé 35 M$ au dernier trimestre.

4. Evelo Biosciences

Valorisation: $89M

Evelo se concentre sur les maladies inflammatoires, car il est désormais démontré que la santé intestinale est étroitement liée aux syndromes inflammatoires. L’accent actuel porte sur les maladies cutanées, en particulier le psoriasis et la dermatite atopique. En plus des problèmes esthétiques et de confort, ces maladies sont également associées à une augmentation des taux de maladies cardiaques, d’asthme, d’arthrite, d’allergies et du syndrome de l’intestin irritable. Essentiellement, les éruptions cutanées ne sont que les symptômes visibles d’une inflammation généralisée et incontrôlée. Les traitements existants sont efficaces à seulement 8 % pour le psoriasis et 2 % pour la dermatite.

Les études de phase II ont été positives sur le psoriasis, avec des essais cliniques de phase III en préparation. Les résultats pour la dermatite étaient moins encourageants, principalement en raison du taux de rémission exceptionnellement élevé dans le groupe placebo, déséquilibrant l’étude.

L’entreprise dispose actuellement de 69 M$ de liquidités au dernier trimestre, avec des dépenses de 30 M$ par trimestre. Cela pourrait entraîner une trésorerie limitée et obliger l’entreprise à diluer les actionnaires actuels, même avec les cours d’actions récemment bas.

5. Seres Therapeutics

Valorisation: $675M

L’entreprise travaille avec Nestlé Health pour faire approuver le SER-109, un traitement oral contre les infections récurrentes à C. difficile. Il s’agit d’une infection difficile à traiter, responsable de 20 000 décès par an rien qu’aux États‑Unis.

L’examen de la FDA pour ce médicament (date PDUFA) est prévu pour le 26^th, 2023, un catalyseur potentiel fort pour l’action.

Le prochain produit sur lequel Seres se concentre est le SER-155, un traitement destiné aux patients immunodéprimés, comme les patients atteints de cancer. Son objectif est de réduire le risque de maladies gastro-intestinales, qui peuvent être très graves chez des patients déjà affaiblis.

Son pipeline comprend également un traitement potentiel pour la colite ulcéreuse (SER-287 & 301) ainsi que des traitements candidats visant à moduler la tolérance aux traitements du cancer.

D’ici 2025, l’entreprise espère que le SER-109 deviendra le traitement standard pour les infections à C. difficile et que le SER-155 sera en phase avancée d’essais cliniques.

En raison de son statut pré-revenus, l’entreprise ne génère pas de flux de trésorerie significatif. En décembre 2022, elle disposait d’un solde de trésorerie de 290 M$ et a récemment émis 100 M$ d’actions.

Construire un portefeuille de microbiome

La thérapie microbiome est une idée très nouvelle, encore entièrement au stade des essais cliniques, même si certains essais sont déjà bien avancés en phase III. Par conséquent, il s’agit d’un secteur d’investissement très spéculatif, comme l’illustre la suspension inattendue des essais de phase III par Finch Therapeutics.

Ce n’est également une idée qui, comme de nombreuses biotechnologies, est tombée en disgrâce auprès des investisseurs au cours des 12 à 18 derniers mois. Cela n’a pas empêché les entreprises du secteur de poursuivre les avancées scientifiques et cliniques.

Des investisseurs agressifs et des spéculateurs pourraient s’intéresser à une société abandonnée comme Finch Therapeutics, cotée à 1/5 de sa valeur en liquidités, ne serait-ce que pour sa valeur de liquidation. Ils pourraient également être à l’aise avec des entreprises nécessitant de nouvelles injections de capitaux dans les deux prochaines années, comme Evelo Biosciences ou Synlogic. Dans ce cas, la stratégie d’investissement consiste à ce que la dilution attendue reste supportable comparée aux gains en capital futurs lorsque les entreprises se rapprochent d’un produit commercialisé.

Les investisseurs plus prudents pourraient préférer se concentrer sur des entreprises disposant d’essais cliniques plus avancés, comme Seres Therapeutics (MCRB ) ou Maat Pharma.

Seres semble être l’une des entreprises les plus avancées du secteur, ciblant le marché important et vaste des infections à C. difficile. La commercialisation pourrait être à seulement un an, voire quelques mois.

Maat Pharma, quant à elle, se concentre sur un marché très niche, mais crucial pour la santé des patients, avec peu d’alternatives existantes.

Les deux ont pour objectif une commercialisation d’ici 2025 et nécessiteront peu de liquidités supplémentaires pour atteindre cet objectif. Néanmoins, il s’agit toujours d’un investissement qui convient le mieux aux investisseurs prêts à prendre des risques, les résultats des essais cliniques pouvant être imprévisibles.