Biotecnología
5 Mejores Empresas de Secuenciación del Genoma
La revolución genómica y multi-ómica
La primera decodificación del genoma humano comenzó en 1990 y se logró por primera vez en 2003. También costó la asombrosa cifra de $3 mil millones.
Avanzando 20 años, los costos de la secuenciación del genoma han caído a $600/genoma. ¡Una reducción de 5 000 000 veces en el costo! Y podría llegar a tan solo $200.
Esto cambió por completo la forma en que abordamos la genómica desde una perspectiva médica. Permite crear y analizar una enorme cantidad de datos y que cada persona pueda potencialmente acceder a una medicina personalizada avanzada que coincida con su composición genética única.
Con la genómica convirtiéndose en una amenidad médica básica, las empresas de secuenciación del genoma se beneficiarán de un mercado de rápido crecimiento y de muchas aplicaciones, desde nutrición y prevención del envejecimiento hasta detección temprana de cáncer.
Y esto no es todo. La misma tecnología que se utilizó para secuenciar el ADN del genoma también puede usarse para crear campos científicos completamente nuevos:
- Metagenómica: secuenciación del genoma de las bacterias que viven en nuestro intestino y que impactan enormemente nuestra salud.
- Transcriptomas & Epigenética: si el genoma es el plano, los transcriptomas son cómo se usa el plano en la práctica y en tiempo real. Esto probablemente será muy relevante para resolver muchas enfermedades incurables y problemas metabólicos.
- Agrigenómica: uso de la genómica para mejorar los rendimientos agrícolas y la productividad de los animales de granja.
- Estudios ecológicos: evaluación precisa de la salud de un ecosistema y diversidad genética.
- Biología sintética: la creación de nuevos genes, rasgos o organismos completos con un propósito específico: por ejemplo, bacterias que comen plástico o algas que producen biocombustible.
Fuente: PacBio
5 Mejores Empresas de Secuenciación del Genoma / Acciones
Este artículo cubre las 5 mejores empresas de secuenciación del genoma que cotizan en bolsa. No cubre empresas igualmente relevantes pero que no cotizan públicamente, como Ultima Genomics o Chinese MGI.
1. Illumina, Inc.
(ILMN )
Illumina es la empresa líder en genómica, de lejos la más grande y establecida en la industria, con $1,2 mil millones en ingresos, que crecieron a una tasa compuesta anual del 11 % en los últimos 5 años.
Fuente: Illumina
Como la mayoría de las empresas de secuenciación del genoma, Illumina gana dinero al vender los secuenciadores, pero principalmente al vender los consumibles que utilizan los secuenciadores, con ingresos por máquina que generalmente crecen con el tiempo a medida que se utilizan a plena capacidad.
El nuevo modelo de secuenciador de la compañía, NovaSeqX, es un éxito, con 109 envíos en el Q2 2023 y se esperan 390 envíos para 2023. Esto ha acelerado la adopción de la secuenciación masiva del genoma entre los clientes de Illumina con más análisis multi-ómicos (mezcla de múltiples técnicas “‑omics”) y mayor escala para análisis de célula única y espaciales.
Al hablar de Illumina, se requiere una larga explicación para una nueva aplicación genómica: detección de cáncer en una muestra de sangre llamada biopsia líquida. Illumina trabajó en esta tecnología y luego la escindió en una empresa llamada Grail.
Grail es muy exitosa tanto técnica como comercialmente, con 7 500 proveedores que prescriben las pruebas de Grail y superó el hito de 100 000 pruebas realizadas en el Q2 2023. También detectó el 92 % de recaídas de cáncer en 6 tipos diferentes de cáncer sanguíneo.
Varios años después, Illumina volvería a adquirir esta empresa a un precio mucho más alto.
Esto provocó varios problemas. Primero, las autoridades regulatorias tanto en EE. UU. como en la UE expresaron preocupaciones sobre el riesgo de monopolio, ya que Illumina es el proveedor de máquinas de secuenciación para muchos de los competidores de Grail.
Esto resultó en una multa de €432 M de la UE. Si este fallo que prohíbe la adquisición no se resuelve, “Illumina desinvertirá Grail en un año si no gana el desafío en el tribunal de la UE.”
Fuente: Illumina
Otro conjunto de problemas surgió de las condiciones del costoso spin‑off de Grail, la recaudación de fondos y la reabsorción en Illumina.
El inversor activista Carl Icahn ha atacado al consejo de la empresa y ha insinuado que se realizaron posibles tratos deshonestos o malintencionados a favor de los internos en contra de los intereses de los accionistas. La SEC también está investigando la cuestión.
Hasta ahora, el CEO ha sido reemplazado, otro miembro del consejo se ha ido, se han incorporado 4 nuevos miembros al consejo, y Illumina ha publicado una “Actualización centrada en la gestión.” También puedes leer más sobre estas sospechas y acusaciones en esta serie de artículos de Non‑GAAP investing.
Las acciones de la compañía han caído bruscamente desde sus máximos de julio 2021, casi un 80 %, volviendo a los niveles de 2013.
Esta es una situación bastante impactante para una empresa grande y establecida como Illumina, sin importar cuán verdaderas sean estas acusaciones, ya que refleja negativamente en su decisión de gestión de desinvertir Grail en primer lugar. Al menos, ha demostrado ser un error costoso.
Los inversores querrán evaluar si están listos para acompañar a Carl Icahn, un legendario y controvertido inversor activista con un historial impresionante. Y si la mala gobernanza de los últimos años ya está totalmente valorada, y quizás ha dañado excesivamente la valoración de la empresa.
2. 10x Genomics, Inc.
(TXG )
10x Genomics es líder en biología espacial, que estudia el genoma y el transcriptoma en 3D, permitiendo la visualización de la actividad de los genes a nivel celular o incluso intracelular.
La empresa se fundó en 2012, con Serge Saxonov entre sus fundadores, director de I+D de la empresa de pruebas genómicas personalizadas 23andMe.
10x Genomics creció mediante una combinación de I+D (más de $1 mil millones invertidos en I+D hasta la fecha) y adquisiciones. Notablemente, su plataforma Visium se obtuvo mediante la adquisición de Spatial Transcriptomics en 2018.
Fuente: 10x Genomics: línea de tiempo de adquisiciones de 10x Genomics
Así es también como 10x Genomics adquirió su Xenium plataforma al adquirir Readcoor y Cartana en 2020.
En 2020, también lanzó la plataforma Chromium, que se actualizó al año siguiente a Chromium X.
Mediante la adquisición de Tetramer Shop en 2021, 10x Genomics también lanzó BEAM (Barcode Enabled Antigen Mapping) en 2022. Permite a los investigadores identificar componentes del sistema inmunitario en detalle. Esto podría ser muy impactante en la investigación de la inmunidad y nuevas enfermedades.
Los ingresos crecieron un 17 % interanual en el Q2 2023, impulsados por las ventas de Xenium, superando el hito de 100 unidades vendidas en agosto de 2023.
La compañía también obtuvo en septiembre 2023 una victoria crítica contra su principal rival, Nanostring. Nanostring está actualmente prohibida de vender sus instrumentos CosMx Spatial Molecular Imager (SMI) en la mayor parte de la UE por infringir patentes de 10x Genomics.
La empresa sigue en una etapa temprana, algo similar a los primeros días de Illumina. Por ahora, la biología espacial está confinada al mundo de la investigación académica y fundamental. Pero, como muchas biotecnologías, podría algún día volverse generalizada, convertirse lentamente en una herramienta médica y luego en una prueba “de rutina”. En cualquier caso, la creciente base de máquinas instaladas debería impulsar las ventas de consumibles y el crecimiento de los ingresos.
3. Oxford Nanopore Technologies plc (ONT.L)
Oxford Nanopore está utilizando una tecnología única de secuenciación del genoma que depende de celdas de flujo. Esto permite “leer” el ADN al cruzar los nanoporos, no mediante procesos químicos sino midiendo directamente una corriente eléctrica. Así, de alguna forma, es la primera vez que una computadora puede leer una secuencia genética (ADN y ARN) en tiempo real.
Fuente: Oxford Nanopore
Otra ventaja única de la tecnología de la compañía es que puede leer secuencias genéticas más largas que los métodos de secuenciación convencionales. Las secuencias largas y la lectura en tiempo real pueden ayudar a obtener resultados mejores y más rápidos, lo cual es importante para el análisis de cáncer o enfermedades infecciosas como bacterias resistentes a antibióticos.
Por último, la medición eléctrica permite secuenciadores más pequeños y portátiles, una mejora respecto a las máquinas masivas usadas hasta ahora. Esto permite a la compañía producir una amplia gama de secuenciadores, incluyendo versiones más lentas, más pequeñas y mucho más baratas, a partir de $1 000. Esto podría expandir radicalmente el mercado de la secuenciación, ofreciendo opciones móviles o de bajo costo que antes no existían.
Los ingresos de Oxford Nanopore crecieron un 46 % CAGR en los últimos 4 años, gracias a 7 300 clientes en el Q2 2023, de los cuales 640 fueron adquiridos en los últimos 12 meses.
Fuente: Oxford Nanopore
Debido a su tecnología radicalmente nueva, no está claro dónde encajará Oxford en un ecosistema de secuenciación del genoma más maduro.
Podría reemplazar completamente la tecnología incumbente de lectura química/óptica de genomas.
O podría convertirse en una aplicación exitosa pero de nicho para secuenciación de bajo volumen o móvil, o para lecturas que requieran alta precisión de secuencias largas.
La compañía también planea expandirse a la lectura de proteínas, modificaciones post‑traduccionales de proteínas o pequeñas moléculas, y otras mediciones en el límite de las ciencias de la vida.
4. Pacific Biosciences of California, Inc.
(PACB )
Iniciada pocos años después de Illumina, PacBio ha sido el jugador más pequeño en la secuenciación del genoma desde entonces. A pesar de su menor tamaño, el equipo de la compañía se ha mantenido en el nivel superior de rendimiento.
PacBio adquirió recientemente Omniome en 2021, dándole una ventaja en precisión para leer secuencias genéticas muy largas o muy cortas. Esta ventaja se reforzó con la posterior adquisición de Apton por $110 M en agosto 2023, que también se especializa en lecturas cortas, alto rendimiento (SR‑HI).
Fuente: PacBio
Los sistemas Onso de PacBio están comenzando a enviarse a clientes, y su lanzamiento ha sido descrito por la compañía como el “mejor comienzo en la historia de PacBio”. Se especializará en secuencias cortas, mientras que su Revio HiFi System podrá leer secuencias largas y operar 24/7, leyendo 1 300 genomas humanos completos al año (aproximadamente 4/día). Posteriormente, el Revio HiFi será reemplazado por el sistema HT SBB, que probablemente integrará la tecnología de Apton.
PacBio espera que las secuencias largas crezcan mucho más rápido que el mercado amplio de NGS y afirma que sus sistemas son 10 veces más precisos que la competencia.
Fuente: PacBio
Curiosamente, también podría reducir el costo total de la secuenciación del genoma. Las secuencias cortas deben volver a ensamblarse en un todo integral sin entrar en demasiados tecnicismos. Así, un genoma de lectura corta de $500 puede rápidamente requerir análisis adicionales que cuestan $1 000 extra para ser realmente útil como herramienta diagnóstica.
Por lo tanto, un análisis de secuencia larga Revio de $950, al ser más preciso, evita este paso y resulta más barato para aplicaciones diagnósticas.
El enfoque de PacBio en análisis de alta precisión y secuencias largas debería darle una ventaja en diagnósticos durante los próximos años. La gerencia de PacBio cree que esto podría impulsar la penetración de mercado de la compañía en la genómica humana del 5 % al 10 % y en oncología (cáncer) del 1 % al 5 %.
Aunque PacBio está mayormente enfocada en su competencia de décadas con Illumina, también podría tener que enfrentarse a Oxford Nanopore en el mercado diagnóstico/de secuencias largas.
Con una historia de ser el competidor más pequeño de Illumina, PacBio es un poco el desvalido del campo y no una nueva “startup emocionante”. Esto no significa que no sea competitivo, y si logra capturar el nicho de mercado en el que se está especializando, podría sorprender positivamente al mercado diferenciándose de su rival histórico.
5. NanoString Technologies, Inc.
(NSTG )
NanoString se lanzó en 2003 para aprovechar la tecnología de codificación molecular digital inventada en el Instituto Seattle de Biología de Sistemas.
Fuente: NanoString
Para 2008, había lanzado su primer producto, nCounter, que representó un gran avance en transcriptómica (el estudio del ARNm). nCounter impulsó a la compañía mientras desarrollaba los siguientes pasos. En 2019, lanzó el GeoMx, seguido del CosMx y la plataforma digital AtoMX.
GeoMx está diseñada para estudiar la expresión de ARN en tejidos completos y también puede analizar más de 150 proteínas, más objetivos que el Xenium de 10x. CosMx Single Molecular Imager (SMI) en cambio puede observar una célula única y lo que ocurre dentro de ella para ARN y hasta 64 objetivos proteicos, y posiblemente hasta 120 en 2024.
Fuente: NanoString
NanoString fue fundamental en la explosión de publicaciones científicas que utilizan biología espacial. No menos de 7 117 publicaciones mencionan las máquinas de NanoString de diversos campos como investigación del cáncer, enfermedades infecciosas (incluido COVID‑19), inmunología, agricultura o neurología.
NanoString está involucrada en una amarga batalla legal con 10x Genomics. La reciente orden judicial del regulador de patentes de la UE afectaría al 10 % de NanoString si la compañía no gana su apelación. Así que, aunque no sea un golpe mortal, sigue siendo una mala noticia para una empresa joven con flujos de efectivo negativos.
Los mercados están claramente preocupados por la viabilidad a largo plazo de NanoString, con la acción por debajo de $2 por acción, bajando desde un máximo de $79 en 2021, y su precio de IPO de $9,1 por acción en 2013.
Los inversores querrán evaluar los planes de la compañía para alcanzar la rentabilidad en 2025 y determinar si la caída del precio es excesiva y representa una oportunidad, considerando que la empresa ha reducido su consumo de efectivo en un 50 % en el Q3 2023.
