Biotecnología
5 Mejores Empresas de Secuenciación del Genoma
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La revolución genómica y multi-ómica
El Proyecto Genoma Humano comenzó en 1990 y presentó en 2003 una secuencia de referencia casi completa del genoma humano. Su presupuesto inicial rondaba los 3.000 millones de dólares y financiaba un amplio programa de investigación, no una sola secuenciación rutinaria.
Veinte años después, los costos de secuenciar un genoma de forma rutinaria habían caído a unos 600 dólares por genoma. También se anunciaron sistemas con costos desde unos 200 dólares en determinadas condiciones. La reducción es enorme, pero el presupuesto total del proyecto inicial no se puede comparar directamente con el costo de una corrida de secuenciación moderna.
Esta evolución ha cambiado las posibilidades médicas de la genómica. Permite recopilar y analizar grandes cantidades de datos para apoyar una medicina personalizada que tenga en cuenta las características genéticas del paciente.
El uso creciente de la genómica ofrece oportunidades a las empresas de secuenciación en nutrición, investigación del envejecimiento y detección temprana del cáncer, entre otros ámbitos. La selección siguiente describe compañías y expectativas desde la perspectiva de 2023.
Las técnicas de secuenciación también contribuyen a varios campos de investigación:
- Metagenómica: estudio del material genético de microorganismos en muestras mixtas, como la microbiota intestinal que influye en nuestra salud.
- Transcriptómica& Epigenética: la transcriptómica estudia los ARN que se expresan, mientras que la epigenética analiza, entre otros procesos, la regulación de genes sin modificar la secuencia del ADN. Juntas ayudan a entender el uso del plano genético en enfermedades y alteraciones metabólicas.
- Agrigenómica: uso de la genómica para mejorar los rendimientos agrícolas y la productividad de los animales de granja.
- Estudios ecológicos: evaluación de la salud de los ecosistemas y de su diversidad genética.
- Biología sintética: diseño de genes, características u organismos para fines concretos, como bacterias que degradan plástico o algas productoras de biocombustible.
Fuente: PacBio
Cinco empresas de secuenciación genómica y análisis molecular / Acciones
La selección examina cinco empresas que cotizaban en bolsa en 2023 y trabajaban en secuenciación o análisis molecular relacionado. No incluye la empresa privada Ultima Genomics ni la china MGI, que cotiza en la Bolsa de Shanghái desde septiembre de 2022.
1. Illumina, Inc.
ILMN Gráfico de precios
En 2023, Illumina era uno de los proveedores más grandes y consolidados de la genómica. Core Illumina registró ingresos anuales de 4.550 millones de dólares en 2022 frente a 2.750 millones en 2017, un crecimiento medio anual cercano al 11%. Los ingresos consolidados del segundo trimestre de 2023 fueron de 1.180 millones de dólares.
Fuente: Illumina
Illumina obtiene ingresos de los instrumentos de secuenciación y, sobre todo, de sus consumibles. Las ventas de consumibles por instrumento pueden crecer a medida que aumenta su utilización.
Illumina entregó 109 instrumentos NovaSeq X en el segundo trimestre de 2023 y elevó la capacidad disponible de entregas del año a más de 390 sistemas. El lanzamiento buscaba apoyar la secuenciación a gran escala y la multiómica, incluidos análisis de células individuales y biología espacial.
La historia de Illumina también incluye la biopsia líquida, es decir, el examen de material en sangre relacionado, entre otras cosas, con el cáncer. La empresa desarrolló esta actividad y la escindió como GRAIL.
En el segundo trimestre de 2023, GRAIL informó de más de 7.500 proveedores sanitarios de EE. UU. que prescribían Galleri y 100.000 pruebas comerciales realizadas. En un estudio separado con la plataforma de metilación de GRAIL se detectó cáncer en el 92% de 428 muestras de sangre de pacientes con seis neoplasias hematológicas, principalmente enfermedad recurrente o resistente al tratamiento. La cifra correspondía a ese estudio, no a la capacidad de Galleri para predecir todas las recaídas.
Illumina recompró GRAIL en 2021 por una valoración mucho mayor.
La operación suscitó preocupaciones de competencia en Estados Unidos y la UE porque Illumina suministraba equipos de secuenciación a varios competidores de GRAIL.
La Comisión Europea impuso en 2023 una multa de 432 millones de euros por completar la adquisición antes de obtener autorización. Illumina recurrió las decisiones. En octubre de 2023, la empresa declaró: «Illumina se desprenderá de GRAIL en un año si no gana el procedimiento ante el tribunal de la UE.»
Fuente: Illumina
Las condiciones de la escisión de GRAIL, la captación de capital y la recompra también generaron interrogantes.
El inversor activista Carl Icahn criticó al consejo de administración y planteó acusaciones sobre posibles conflictos de intereses y perjuicios para los accionistas. En julio de 2023, Illumina reveló una investigación de la SEC sobre la adquisición de GRAIL, declaraciones y comunicaciones, así como la conducta y remuneración de algunos directivos. Las acusaciones y la investigación no constituían una determinación de culpabilidad.
Para el otoño de 2023, el director ejecutivo había salido, otro consejero había dimitido y se habían incorporado cuatro miembros nuevos. Illumina publicó además una «Stewardship-Focused Update». Las sospechas y acusaciones de entonces se examinan también en la serie de artículos de Non‑GAAP investing.
Según la instantánea de mercado del artículo de 2023, la acción había caído casi un 80% desde el máximo de julio de 2021 y regresado aproximadamente a los precios de 2013.
Los hechos supusieron un importante revés financiero y de gobierno corporativo para una empresa consolidada. Plantearon dudas sobre la escisión inicial y la recompra de GRAIL.
Para los inversores de 2023, la evaluación incluía los efectos de la campaña de Icahn, las mejoras de gobierno corporativo y en qué medida los riesgos estaban ya reflejados en el precio de la acción.
2. 10x Genomics, Inc.
TXG Gráfico de precios
10x Genomics (TXG ) desarrolla herramientas de análisis de células individuales y biología espacial. Permiten estudiar la actividad génica y otras características moleculares y, en los análisis espaciales, conservar información sobre su ubicación en el tejido.
La empresa se fundó en 2012, entre otros por Serge Saxonov, quien anteriormente había dirigido investigación y desarrollo en la compañía de pruebas genéticas personales 23andMe.
10x Genomics combinó investigación y desarrollo internos con adquisiciones. Su presentación empresarial citaba más de 1.000 millones de dólares de inversión acumulada en I+D. La compra de Spatial Transcriptomics en 2018 contribuyó al desarrollo de Visium.
Fuente: 10x Genomics: línea de tiempo de adquisiciones de 10x Genomics
Las compras de ReadCoor y Cartana en 2020 aportaron tecnología para la plataforma Xenium , desarrollada posteriormente por 10x y lanzada en 2022.
La compañía introdujo la plataforma Chromium en 2016 y la amplió con la serie Chromium X en 2021.
Tras adquirir Tetramer Shop en 2021, 10x Genomics introdujo también BEAM (Barcode Enabled Antigen Mapping) en 2022. Estas herramientas permiten investigar el reconocimiento de antígenos por las células inmunitarias, relevante para el estudio de la inmunidad y las enfermedades.
Los ingresos del segundo trimestre de 2023 aumentaron un 17% interanual. El lanzamiento de Xenium contribuyó a la evolución, y las entregas de sistemas Xenium superaron las 100 unidades en agosto de 2023.
La empresa obtuvo en septiembre de 2023 una medida cautelar contra su competidora NanoString del Tribunal Unificado de Patentes, UPC. Abarcaba productos CosMx para detección de ARN en 17 Estados participantes de la UE, no todos los productos NanoString en toda la Unión. El litigio seguía abierto.
En 2023, la biología espacial era principalmente un campo de investigación académica y básica. Su desarrollo podía ampliar la utilidad clínica, pero no garantizaba una prueba médica rutinaria. Una base instalada creciente también podía apoyar las ventas de consumibles.
3. Oxford Nanopore Technologies plc (ONT.L)
Oxford Nanopore está utilizando una técnica en la que ADN o ARN atraviesan nanoporos de una celda de flujo. Las variaciones de la corriente eléctrica proporcionan información sobre las moléculas y permiten determinar su secuencia.Las mediciones se pueden procesar durante la corrida, con datos de secuencia disponibles en tiempo real.
Fuente: Oxford Nanopore
Una ventaja es la lectura de fragmentos largos de ADN, junto con otras longitudes disponibles. Las lecturas largas y el procesamiento rápido pueden ayudar en la investigación del cáncer, las infecciones y la resistencia a los antibióticos.
La detección eléctrica también permite instrumentos compactos y portátiles. En 2023, Oxford Nanopore ofrecía dispositivos y paquetes iniciales desde unos 1.000 dólares, además de sistemas mayores. Esto facilita el trabajo de campo y experimentos pequeños.
Según la presentación de la compañía, los ingresos de Life Science Research Tools (LSRT) crecieron un promedio anual del 46% entre 2018 y 2022. En los doce meses hasta el 30 de junio de 2023 había más de 7.300 cuentas de clientes directos activas, con un aumento neto superior a 640 en ese período.
Fuente: Oxford Nanopore
Desde la perspectiva de 2023, todavía estaba abierta la posición futura de Oxford Nanopore en un mercado de secuenciación más maduro.
La tecnología podía competir en distintas aplicaciones con métodos consolidados de detección química y óptica.
Otras oportunidades incluían sistemas portátiles, pequeños volúmenes de muestras y análisis que necesitaran lecturas largas.
La compañía investigaba además el análisis de proteínas, sus modificaciones postraduccionales, moléculas pequeñas y otras características moleculares.
4. Pacific Biosciences of California, Inc.
PACB Gráfico de precios
Fundada unos años después de Illumina, PacBio siguió siendo una compañía menor de secuenciación, centrada también en lecturas largas de alta precisión.
PacBio adquirió Omniome en 2021 y añadió la tecnología de lecturas cortas sequencing by binding (SBB) a su tecnología existente de lecturas largas. El paso siguiente fue la adquisición de Apton anunciada en agosto de 2023, por un valor de hasta 110 millones de dólares. Apton desarrollaba secuenciación de lecturas cortas de alta capacidad. El acuerdo incluía unos 85 millones iniciales y hasta 25 millones al alcanzar un hito de ingresos.
Fuente: PacBio
Los sistemas Onso de PacBio comenzaron a entregarse a clientes en agosto de 2023. La compañía describió el lanzamiento como el «mejor comienzo en la historia de PacBio». Onso estaba destinado a lecturas cortas. Revio empleaba HiFi para lecturas largas y ofrecía una capacidad declarada de hasta unos 1.300 genomas humanos anuales con cobertura de 30×. Por separado, PacBio desarrollaba un sistema de lecturas cortas de alta capacidad basado en SBB y tecnología Apton.
PacBio esperaba que la secuenciación de lecturas largas creciera más rápido que el mercado general de secuenciación de nueva generación. En una comparación presentada por la empresa, HiFi se describía como unas diez veces más preciso que el otro método de lecturas largas analizado.
Fuente: PacBio
El costo total del análisis depende también de pruebas adicionales. En un ejemplo diagnóstico de la presentación de PacBio, la secuenciación de lecturas cortas costaba 500 dólares, pero análisis complementarios podían elevar el total por encima de 1.500 dólares.
Un experto citado en la presentación consideraba por ello atractivo un genoma Revio de 950 dólares para esas aplicaciones diagnósticas. Era una comparación concreta, no un precio general para todo el proceso diagnóstico.
PacBio veía oportunidades en lecturas largas precisas. La dirección calculaba que su penetración de mercado entre 2022 y 2026 podía pasar de menos del 5% a menos del 10% en genómica humana y de menos del 1% a menos del 5% en oncología.
Además de Illumina, Oxford Nanopore era un competidor potencial importante en métodos de lecturas largas e investigación médica.
PacBio era un competidor menor pero consolidado, no una nueva empresa emergente. Según el análisis de 2023, una posición más fuerte en aplicaciones especializadas podía ayudarla a diferenciarse de rivales mayores.
5. NanoString Technologies, Inc.
NanoString se fundó en 2003 para desarrollar códigos de barras moleculares digitales a partir de tecnología del Institute for Systems Biology de Seattle.
Fuente: NanoString
Para 2008, había lanzado su primer producto, nCounter, para analizar la expresión génica. El producto sentó la base del desarrollo posterior. En 2019 llegó GeoMx, seguido de CosMx y la plataforma digital AtoMx.
GeoMx analiza expresión de ARN y dianas proteicas en tejidos conservando la información espacial. Los paneles descritos en 2023 comprendían más de 150 proteínas; la comparación con Xenium depende del tipo de análisis y del panel.CosMx Spatial Molecular Imager (SMI) mapea ARN y proteínas a nivel de células individuales en el tejido. El artículo citaba entonces 64 dianas proteicas y una posible ampliación a 120 en 2024.
Fuente: NanoString
NanoString contribuyó al crecimiento de publicaciones sobre análisis molecular y biología espacial.Las 7.117 publicaciones mencionadas en el artículo utilizaban tecnología NanoString en áreas como cáncer, enfermedades infecciosas incluido COVID-19, inmunología, agricultura y neurología.
En 2023, NanoString afrontaba un importante litigio de patentes con 10x Genomics.La medida cautelar del UPC de septiembre de 2023 limitaba la venta de productos CosMx para detección de ARN en los países participantes de la UE. NanoString estimaba que menos del 10% de los pedidos pendientes de instrumentos CosMx de entonces correspondía a esos países y recurrió. La cuestión era relevante para una empresa con flujo de caja negativo.
La instantánea de mercado del artículo de 2023 reflejaba inquietud por las perspectivas financieras de NanoString: la acción estaba por debajo de 2 dólares, frente al máximo de 79 dólares de 2021 citado en el texto. El precio de salida a bolsa en 2013 fue de 10 dólares por acción.
Los inversores debían evaluar entonces el objetivo de la dirección de lograr rentabilidad en 2025. Era una previsión. NanoString informó de que el consumo de efectivo del tercer trimestre de 2023 había caído casi un 50% respecto al trimestre anterior.
