Biotechnologie
10x Genomics (TXG): Biologische gegevens naar een nieuw niveau brengen

Waarom ruimtelijke biologie van belang is
In het afgelopen decennium zijn precisietherapieën en next-generation sequencing (NGS) sterk in opkomst gekomen en hebben ze diagnostiek en geneeskunde ingrijpend veranderd. Dankzij deze methoden konden artsen en onderzoekers overstappen van een aanpak die het hele lichaam behandelt, zoals met geneesmiddelen, naar gerichte behandeling of detectie van een specifiek celtype of een bepaalde DNA-sequentie.
Toch is dit niet het diepste niveau dat biologische analyse kan bereiken. Zelfs binnen één orgaan of weefseltype, zoals de hersenen of een tumor, kunnen afzonderlijke cellen zich heel verschillend gedragen.
Terwijl instrumenten zoals NGS-sequencers gegevens van duizenden of zelfs miljoenen cellen tegelijk samenvoegen, moeten onderzoekers vaak met nanometerprecisie vaststellen wat er in één afzonderlijke cel gebeurt. Om dat detailniveau te bereiken ontstond een nieuw wetenschapsgebied: ruimtelijke biologie. Eén bedrijf ontwikkelt zich daarbij tot marktleider: 10x Genomics (TXG ).
TXG Prijsgrafiek
Wat is ruimtelijke biologie?
Wat ruimtelijke biologie meet (en waarom)
In plaats van naar het ‘mengsel’ van moleculen in een monster te kijken, kan ruimtelijke biologie bepalen waar een relevant molecuul, zoals een specifieke RNA-sequentie, zich in een weefsel of afzonderlijke cel bevindt. Dat kan in twee of drie dimensies.
Hiermee kunnen onderzoekers zien hoe cellen met elkaar interageren, hoe afweermechanismen worden geactiveerd en hoe een cel reageert op contact met een virus.
Deze aanpak levert bovendien veel gevoeligere gegevens op. Een proces dat slechts in enkele cellen plaatsvindt, kan in een groter monster onzichtbaar blijven, terwijl de gerichte aanpak van ruimtelijke biologie de sleutelrol van plaatselijke verschijnselen of zeldzame celtypen kan blootleggen.
Belangrijker nog is dat de verzamelde gegevens in de context van de bredere activiteit van omliggende cellen in het weefsel kunnen worden geplaatst. Dat is veel informatiever dan analyse van een geïsoleerde cel of microdissectie.
“Ruimtelijk geresolueerde transcriptomics benadrukt hoe deze technologieën zijn volwassen geworden en uitgebreid om biologen uitzonderlijke inzichten te geven in de biologie van individuele cellen, terwijl ze informatie over de ruimtelijke context behouden.”
Nature: Methode van het Jaar 2020: ruimtelijk geresolueerde transcriptomics
Belangrijke ruimtelijke-omics modaliteiten
Ruimtelijke biologie kan worden gebruikt om levende cellen te begrijpen en specifieke signalen te analyseren. De belangrijkste biologische activiteiten die op deze manier kunnen worden gemeten, zijn:
- Spatial Genomics: de analyse van het DNA en het genoom.
- Spatial Transcriptomics: de analyse van mRNA, de feitelijke activiteit van de codering van het genoom.
- Spatial Proteomics: de analyse van tot expressie gebrachte eiwitprofielen zoals antilichamenreceptoren, immuunmarkers, enz.
- Spatial Metabolomics: de analyse van specifieke biomoleculen, zoals hormonen, kankermarkers, enz.
10x Genomics: Bedrijf & Platforms
10x Genomics is een van de pioniers op het gebied van single‑cell analyse en ruimtelijke biologie, en ontwikkelt sinds de oprichting in 2012 apparatuur in dit veld. Een van de oprichters, Serge Saxonov, was eerder de oprichtende architect en directeur onderzoek en ontwikkeling bij het genetische testbedrijf 23andMe.
10x Genomics ging in 2019 naar de beurs en heeft sindsdien een reeks single‑cell en ruimtelijke biologie‑analyse‑tools uitgebracht.

Bron: 10x Genomics
Chromium, Visium HD en Xenium
In totaal heeft het bedrijf meer dan 7.000 analyse-instrumenten verkocht, waarvan ruim 1.050 alleen al in 2024.
Hoewel zuivere ruimtelijke biologie het bedrijf technisch vooruithelpt, is het Chromium-platform voor single-cellanalyse vooralsnog het best verkochte product, met meer dan 5.800 verkochte systemen.

Bron: 10x Genomics

Bron: 10x Genomics
De twee andere belangrijke platforms van 10x Genomics zijn Visium en Xenium:
- Visium gebruikt NGS (genomisch) om een volledig transcriptoom te creëren voor elk klein gebied van 2 µm van een weefselmonster.
- Xeniumgebruikt beeldvorming (microscopie) om de genexpressie van gerichte genen (tot 5.000 genen) te meten voor elke individuele cel in een weefselmonster.
Visium is vooral nuttig voor onderzoekers die een overzicht willen van de biologische activiteit in een bepaald gebied, terwijl Xenium inzicht geeft in specifieke activiteiten waarvan al bekend is dat ze voor een bepaalde casus relevant zijn.
Naarmate meer gegevens beschikbaar komen en de mogelijkheden van Xenium toenemen, zal alomvattende single-cellanalyse op weefselmonsterniveau waarschijnlijk de nieuwe gouden standaard voor biotechnologisch onderzoek worden.
Veeg om te scrollen →
| Platform | Primaire techniek | Wat het meet | Resolutie | Typische gebruikssituaties |
|---|---|---|---|---|
| Chromium | Single‑cell partitionering + NGS | Volledig transcriptoom single‑cell profielen (plus ATAC, V(D)J) | Cell‑niveau (geen ruimtelijke context) | Ontdekking van celtypen, trajectanalyse, immuunrepertoire |
| Visium HD | Ruimtelijke genexpressie (NGS) | Volledig transcriptoom over weefselsecties | ~2 µm pixels (single‑cell schaal) | Weefselarchitectuur, micro‑omgevingsmapping |
| Xenium | In‑situ beeldvorming (gericht) | Gerichte RNA (tot 5.000 genen) ± eiwit per cel | Subcellulair; per‑cel metingen | Pathologie‑gerelateerde studies, biomarkervalidatie |
Financiën van 10x Genomics
Deze activiteiten leverden in 2024 een omzet van 611 miljoen dollar op, waarvan 493 miljoen dollar afkomstig was uit verbruiksartikelen.
Het hoge aandeel verbruiksartikelen in de totale omzet laat zien dat het bedrijfsmodel lijkt op dat van NGS-bedrijf Illumina (ILMN ): de verkoop van apparatuur leidt tot langdurige, terugkerende omzet uit chemicaliën, kleurstoffen, reagentia en andere verbruiksartikelen die nodig zijn om de systemen te laten werken.
Overnames
Het bedrijf completeerde zijn technische aanbod in 2018 met de overname van Epinomics, een biotechnologiebedrijf dat zich richtte op epigenetica, en Spatial Transcriptomics, dat zich toelegde op ruimtelijke genomica.
Daarna volgden de overnames van CARTANA (detectie van moleculen in de cel, in situ) en ReadCoor (subcellulaire 3D-resolutie op nanoschaal) in 2020, Tetramer (weefselanalyse in hoge resolutie) in 2021 en Scale Biosciences (schaalbare single-cellanalyse) in 2025.
Hierdoor is 10x Genomics niet alleen een innovator, maar ook een bedrijf dat opkomende technologieën van kleinere innovatieve teams samenbrengt. Het integreert deze in één samenhangend geheel met een gemeenschappelijk analyseplatform en gedeelde instrumenten, zodat onderzoekers één apparaat voor meerdere analysetypen kunnen gebruiken.
Dit is belangrijk voor efficiënte R&D, omdat resultaten van verschillende apparaten en analysemethoden moeilijk te vergelijken kunnen zijn, waardoor uiteenlopende resultaten uit meerdere bronnen minder bruikbaar worden.
Marktvooruitzicht voor ruimtelijke biologie (2025–2030)
Door het uitzonderlijk hoge informatieniveau concurreert ruimtelijke biologie rechtstreeks met veel minder nauwkeurige en krachtige traditionele analysemethoden, van decenniaoude technieken zoals ELISA, western blot en PCR tot geavanceerdere methoden zoals flowcytometrie en bulksequencing.

Bron: 10x Genomics
Ruimtelijke biologie, ook wel ruimtelijke omics genoemd, vertegenwoordigde in 2024 een markt van 711 miljoen dollar en zal naar verwachting bij een samengestelde jaarlijkse groei van 16,3% in 2030 uitkomen op 1,7 miljard dollar.
De erkenning door Nature in 2020 als veelbelovende techniek vormde het eerste omslagpunt, maar pas nu gaat de technologie vanuit omzetperspectief een exponentiële groeifase in.

Bron: Grand View Research
De markt wordt voorlopig vooral gedomineerd door universiteiten en onderzoeksinstituten. Biotechnologie- en farmaceutische bedrijven beginnen de technologie pas net te gebruiken voor hun toegepaste R&D. Steeds meer toonaangevende wetenschappelijke publicaties gebruiken apparatuur van 10x Genomics, omdat het publiceren van nieuwe ontdekkingen zeer competitief is.

Bron: 10x Genomics
Naarmate toonaangevende publicaties ruimtelijke biologie vaker gebruiken om nieuwe inzichten te verkrijgen, wordt de technologie ook gangbaarder in onderzoekslaboratoria die concurrerend moeten blijven om in vooraanstaande tijdschriften te kunnen publiceren.
Naar verwachting zal de vraag uit de private sector in de toekomst echter het grootste deel van de nieuwe verkopen aanjagen. De technologie wordt beter begrepen en is goedkoper geworden, terwijl een groeiende kennisbasis van publicaties en databanken en een groter aantal opgeleide biologen kunnen worden ingezet om praktische toepassingen te ontwikkelen.
10x Genomics verwacht dat de omzet uit biofarmaceutische klanten de komende jaren zal stijgen van 20% naar 50% van de totale omzet.
Concurrentie in ruimtelijke & single‑cell biologie
Ruimtelijke biologie
De markt voor ruimtelijke biologie kan worden ingedeeld naar het geografische bereik en de technische expertise van de bedrijven. Alleen 10x Genomics en Bruker combineren een wereldwijde aanwezigheid met mogelijkheden die verder gaan dan een smalle technische niche.

Bron: Grand View Research
Bruker kocht de activa van 10x Genomics-concurrent NanoString toen dit bedrijf in 2024 failliet ging. Bruker voegde NanoString samen met de eerder overgenomen ondernemingen Canopy Biosciences en Acuity Genomics tot Bruker Spatial Biology.
NanoString en 10x Genomics waren sinds 2023 verwikkeld in een complexe octrooirechtszaak, die aanzienlijk heeft bijgedragen aan het faillissement van NanoString in 2024.
In mei 2025 beëindigden de twee bedrijven hun geschil met een wereldwijde kruislicentieovereenkomst die alle rechtszaken afsloot. Voor de aandeelhouders van beide ondernemingen is dit positief, omdat een groot deel van de onzekerheid rond de juridische procedures verdween.
“We zijn enthousiast dat we ons kunnen richten op de impact en waarde die deze producten bieden voor ontdekkingsonderzoek, translationeel onderzoek en precisiegeneeskunde, en we zijn blij dat de afleiding en kosten van deze juridische zaken achter ons liggen.”
Concurrenten van single‑cell platformen
De markt voor single-cellanalyse is iets competitiever. Ook grote fabrikanten van laboratoriumapparatuur worden actief, zoals blijkt uit de overname van single-cellanalysebedrijf Parse Biosciences door Qiagen voor 225 miljoen dollar, plus mijlpaalbetalingen.
Deze markt kan geleidelijk competitiever worden naarmate single-cellanalyse gangbaarder wordt en nieuwe technologieën de dominante positie van het Chromium-platform van 10x Genomics uitdagen.
Omdat de markt 3,5 miljard dollar groot is en jaarlijks met 14,5% groeit, is er waarschijnlijk ruimte voor meerdere spelers die elk een eigen niche innemen, afhankelijk van de technische eisen en de reeds geïnstalleerde apparatuur in een laboratorium.
Van onderzoek naar diagnostiek: wat komt er hierna
Ruimtelijke biologie is momenteel vooral een onderzoeksinstrument waarmee de activiteit van levend weefsel met een nooit eerder bereikte nauwkeurigheid kan worden bestudeerd. Dat lijkt sterk op het gebruik van geavanceerde NGS-instrumenten in de jaren tachtig en negentig om onze kennis van menselijke en niet-menselijke biologie te vergroten.
Naarmate deze instrumenten goedkoper werden en de kennis toenam, werden steeds nieuwe NGS-toepassingen ontwikkeld en groeide de technologie uit tot basisuitrusting van biologielaboratoria.
Eenvoudige genetische tests zijn inmiddels een gangbaar diagnostisch hulpmiddel, zoals de alomtegenwoordige PCR-tests tijdens de coronapandemie duidelijk maakten.
Ruimtelijke biologie zal waarschijnlijk dezelfde ontwikkeling doormaken. Na het huidige gebruik in academisch onderzoek zal de toepassing door biotechnologie- en farmaceutische bedrijven blijven groeien: eerst in hun eigen toegepaste onderzoek en vervolgens in de diagnostiek, aanvankelijk bij ernstige aandoeningen zoals kanker en later steeds vaker bij routinecontroles.
Dit biedt bedrijven zoals 10x Genomics veel groeiruimte naarmate de technologie volwassen wordt, vergelijkbaar met de ontwikkeling van de oudere NGS-tegenhanger Illumina.
AI en ruimtelijke biologie: trainingsdata voor Bio‑AI
AI-analyse wordt een cruciaal hulpmiddel in de biologie. Dat is niet verrassend, aangezien de enorme omvang en complexiteit van biologische gegevens een van de grootste obstakels voor vooruitgang in de biotechnologie vormt.
De apparatuur van 10x Genomics maakt volledig gecontextualiseerde, samenhangende en ruimtelijk opgeloste datasets en is daardoor bijzonder geschikt voor het produceren van trainingsgegevens voor biotechnologische AI.
“Deze technologieën hebben biologische ontdekkingen al versneld, en met de innovatiemotor van 10x zal die impact alleen maar toenemen.
Deze integratie helpt de onderzoeksgemeenschap hoogwaardige gegevens te genereren die nodig zijn voor door AI aangedreven doorbraken in de geneeskunde.”
Garry Nolan, PhD, medeoprichter van Scale Biosciences (in 2025 overgenomen door 10x Genomics)
Hierdoor kunnen onderzoekers beter bepalen welke gegevens nog moeten worden gegenereerd, wat de vraag naar analyse-instrumenten voor ruimtelijke biologie verder kan vergroten.

Bron: 10x Genomics
AI maakt ruimtelijke biologie bovendien nuttiger, omdat het de enorme gegevensstroom kan verwerken die de technologie voortbrengt.
Gegevensanalyse is al lange tijd een van de grootste knelpunten in single-cellonderzoek en ruimtelijk biologisch onderzoek.
Onze recente samenwerking met Anthropic helpt dit probleem aan te pakken en maakt analyse toegankelijker door integratie met Claude for Life Sciences.
Met Claude kunnen onderzoekers gangbare analysetaken nu uitvoeren via een gespreksinterface die onze bestaande computationele workflows aanvult.
Dergelijke inzichten kunnen wetenschappers bijvoorbeeld helpen tumortypen beter te classificeren en de respons op behandelingen nauwkeuriger te voorspellen, wat uiteindelijk tot betere resultaten voor patiënten leidt.

Bron: 10x Genomics
Uiteindelijk kan een voldoende grote gegevensverzameling helpen bij het verwezenlijken van de zogeheten “heilige graal van de biologie”: een door AI aangedreven virtuele cel die realistisch genoeg is om echte levende cellen nauwkeurig te simuleren.
Er zijn sterke redenen om te verwachten dat het opschalen van gegevens tot veel krachtigere modellen zal leiden, zoals bij vrijwel alle andere toepassingen van kunstmatige intelligentie.
Deze modellen kunnen de wetenschap, geneesmiddelenontwikkeling en uiteindelijk de menselijke gezondheid transformeren. Wij denken dat virtuele-celonderzoek de komende jaren een van de belangrijkste ontwikkelingen in de biologie zal zijn.
Conclusie
10x Genomics beweegt zich van de fase van een innovatieve startup met een interessante technologie naar een sleutelpartner voor de meeste biologische onderzoeksorganisaties, zowel academisch als commercieel.
Het data‑rijke begrip van levende cellen en weefsels, gecreëerd door ruimtelijke biologie en single‑cell analyses, levert het soort informatie dat op het juiste moment kan worden benut door steeds krachtigere AI’s.
Dit zou op zijn beurt de ontdekkingssnelheid in biotech moeten versnellen en de apparatuur voor ruimtelijke biologie nog nuttiger maken, waardoor een positieve feedbacklus ontstaat.
Dit betekent niet dat het bedrijf een perfect veilige investering is. Omdat het opereert in een snel veranderend veld, is de concurrentie nog steeds intens, en NanoString, nu herrezen binnen Bruker, of bedrijven zoals Qiagen, zouden serieuze concurrenten kunnen zijn.
Maar voor nu heeft de snelle innovatie en strategische overnames van 10x Genomics het in een solide positie geplaatst om het veld te domineren.












