Bioteknologi

CRISPR Mungkin Memainkan Peran Kunci dalam Teknologi Baru yang Digunakan untuk Mengidentifikasi Virus seperti H5NI dan Influenza

mm
Diterbitkan
Diperbarui
Tambahkan Securities.io ke sumber pilihan Anda di Google
Pengungkapan: Securities.io dapat menerima kompensasi saat Anda memakai tautan ke produk yang kami ulas. Hal ini tidak memengaruhi penilaian editorial kami. Kami bukan penasihat investasi terdaftar; ini bukan saran investasi. Baca pengungkapan afiliasi kami.

CRISPR Dapat Melakukan Lebih dari Pengeditan Gen

CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) paling dikenal sebagai alat untuk rekayasa genetika dan baru-baru ini menyembuhkan penyakit genetik seperti sel sabit. Kami mengeksplorasi banyak aplikasi ini dalam artikel kami “Dari Kebutaan hingga Pengganti Daging: Pengeditan Gen CRISPR Terus Menghasilkan Hasil Menjanjikan”.

Apa yang membuat CRISPR unik sebagai alat genetik adalah kemampuannya untuk mencocokkan dan mengidentifikasi urutan genetik yang tepat secara akurat.

Akurasi ini kini dialihkan untuk pengujian penyakit dan mungkin lebih sederhana digunakan serta lebih hemat biaya dibandingkan tes PCR yang lebih umum.

Peneliti dari Broad Institute, MIT, dan Universitas Princeton mengumumkan peluncuran tes strip berbasis teknologi CRISPR, yang dapat membedakan antara dua tipe utama flu musiman, influenza A dan B, serta subtipe flu musiman H1N1 dan H3N2.

Bagaimana Cara Kerjanya?

Teknologi ini pertama dikembangkan pada tahun 2020, dengan nama SHINE (Streamlined Highlighting of Infections to Navigate Epidemics). Ini dibangun di atas metode tes berbasis CRISPR yang sebelumnya dikembangkan, SHERLOCK (Specific High-sensitivity Enzymatic Reporter unLOCKing). Meskipun SHERLOCK efisien, banyaknya langkah dalam metode tersebut meningkatkan risiko kesalahan dan pembacaan yang keliru.

Sumber: Nature

Metode SHINE yang baru dapat mendeteksi virus baik dengan pembacaan kolorimetri berbasis kertas maupun pembacaan fluoresen dalam tabung. Selain itu, hasil pembacaan fluoresen dapat diinterpretasikan secara otomatis melalui aplikasi smartphone pendamping.

Mengapa Hal Ini Penting

Pengujian PCR mahal dan memerlukan peralatan khusus. Akibatnya, hanya sejumlah kecil pasien yang diuji (kecuali dalam kondisi pandemi), biasanya hanya segmen pasien yang mengunjungi rumah sakit alih-alih dokter keluarga mereka.

Pengujian antigen sering digunakan sebagai alternatif pengujian PCR, namun jauh kurang dapat diandalkan dan sensitif.

Dengan identifikasi strain yang tepat dengan biaya dan kompleksitas yang rendah, klinisi dapat, misalnya, memutuskan apakah akan menggunakan Oseltamivir. Antiviral umum ini efektif hanya untuk beberapa strain.

Aplikasi lain adalah membantu ilmuwan memantau wabah epidemi dengan lebih baik melalui pengujian cepat di lapangan.

CRISPR Mengungguli Metode Sebelumnya

Ekspansi SHINE pada tahun 2024 ke berbagai strain flu bertujuan menggantikan metode yang saat ini digunakan di laboratorium patologi, khususnya PCR.

Pendekatan diagnostik tipikal seperti polymerase chain reaction (PCR) memerlukan waktu proses yang lama, tenaga terlatih, peralatan khusus, dan freezer untuk menyimpan reagen pada -80°C, sedangkan SHINE dapat dilakukan pada suhu ruang dalam sekitar 90 menit. Saat ini, uji hanya memerlukan blok pemanas murah untuk menghangatkan reaksi, dan peneliti sedang berupaya menyederhanakan proses dengan tujuan memberikan hasil dalam 15 menit.

Secara keseluruhan, tes berbasis CRISPR dapat berperformasi lebih baik dari perspektif praktis dan komersial serta pada akhirnya menggantikan PCR ketika menguji virus yang sangat bervariasi seperti flu dan coronavirus.

Virus Berikutnya dalam Antrian

Versi berikutnya dari tes strip berbasis CRISPR kemungkinan akan diperluas sehingga dapat digunakan untuk mendeteksi virus flu dan strain yang ada serta membedakan antara virus dengan gejala serupa, seperti coronavirus dan influenza (virus flu).

Topik mendesak lainnya adalah strain influenza unggas dan babi. Penyakit ini menghancurkan operasi pertanian. Mereka menimbulkan risiko serius bagi kesehatan manusia, bahkan berpotensi menyebabkan pandemi baru jika virus ini beradaptasi dari inang hewan ke manusia.

Karena keberhasilan yang telah terbukti sebelumnya dengan COVID dan kini flu, kemungkinan tes berbasis CRISPR seperti SHINE akan segera menjadi jauh lebih umum. Ini akan sangat berguna untuk virus yang berkembang cepat, di mana melacak penyebaran berbagai strain sangat penting, tugas yang biasanya strip antigen lakukan dengan buruk.

Perusahaan CRISPR

1. Ginkgo Bioworks

DNA Grafik Harga

Perusahaan ini memproduksi organisme sesuai permintaan untuk aplikasi spesifik. Ini mencakup aplikasi biomedis serta banyak program industri dan ilmu material.

Ia juga memiliki segmen biosecurity yang besar, yang berkembang pesat selama pandemi.

Ginkgo Bioworks (DNA ) telah mendiversifikasi aplikasinya secara luas dengan banyak program riset dan kemitraan:

Perusahaan menghasilkan uang dengan menerima pembayaran di muka untuk proses pengembangan dan kemudian melalui royalti pada produk jadi.

Kemitraan Gingko terus berkembang, dengan:

Ginkgo Bioworks juga bermitra dengan semua perusahaan pertanian besar, yang sebagian besar memiliki kepentingan dalam produksi biofuel dan mikrobiologi. Beberapa di antaranya termasuk Bayer, Cargill, Syngenta, Corteva, ADM, Exacta, dan lainnya.

Pengalaman Gingko dalam desain khusus urutan genetik, serta dalam pemantauan biosecurity menjadikannya kandidat yang baik untuk memanfaatkan munculnya metode pengujian berbasis DNA baru.

Jadi dengan tes berbasis CRISPR kini terbukti sebagai alternatif yang layak untuk tes PCR (pasar yang sangat besar, bahkan di luar kondisi pandemi), Gingko mungkin dapat memanfaatkan pengalaman dan kemitraannya untuk merebut sebagian pasar yang sedang berkembang ini.

2. Editas Medicine, Inc.

EDIT Grafik Harga

Editas didirikan oleh Jennifer Doudna, penemu CRISPR-Cas9. Editas awalnya bekerja dengan Cas9 tetapi kini fokus pada versi kepemilikan Cas12 yang mereka rancang: AsCas12a.

Anda dapat membaca lebih lanjut tentang sifat unik Cas12a dalam artikel khusus kami “Apa Itu CRISPR-Cas12a2? & Mengapa Itu Penting?”.

Singkatnya, Cas12as unik karena:

  • Masalah yang sulit diselesaikan dengan Cas9 dapat diatasi dengan Cas12a
  • Ini menghasilkan peluang pengeditan gen yang lebih tinggi dibandingkan dengan Cas9.
  • Lebih dari satu gen dapat dimodifikasi sekaligus dengan Cas12a.

Anda juga dapat membaca ikhtisar semua perusahaan milik Jennifer Doudna dalam artikel terkait “Perusahaan Jennifer Doudna Teratas untuk Dipantau.”

Editas fokus pada Penyakit Sel Sabit (SCD) dan beta-talasemia, 2 penyakit di mana mereka kalah dalam perlombaan persetujuan pengobatan pertama dibandingkan pesaing CRISPR Therapeutics dan BlueBirdBio (CRSP ).

Meskipun demikian, Editas memiliki paten signifikan pada CRISPR-Cas12, yang telah digunakan oleh peneliti lain di University of New South Wales, Australia, untuk mengembangkan tes strip COVID-19 (tes strip dari peneliti Broad Institute yang disebutkan di atas menggunakan CRISPR-Cas13).

Editas fokus pada versi CRISPR lain selain “klasik” CRISPR-Cas9 yang dapat membantu mereka masuk cepat ke pasar tes strip CRISPR dan mengomersialkan (dengan atau tanpa kemitraan) versi tes strip mereka sendiri yang dikembangkan oleh peneliti di universitas terkemuka.

mm

Jonathan adalah mantan peneliti biokimia yang bekerja dalam analisis genetik dan uji klinis. Ia kini menjadi analis saham dan penulis keuangan dengan fokus pada inovasi, siklus pasar, dan geopolitik dalam publikasinya 'The Eurasian Century'.