5 Parasta Genomin Sekvensointiyritystä

Genominen ja mon-ominen vallankumous

Ensimmäinen ihmisen genomin dekoodaus alkoi vuonna 1990 ja saavutettiin ensimmäisen kerran vuonna 2003. Se maksoi myös huikeat $3B.

Siirryttäessä 20 vuotta eteenpäin, genomin sekvensoinnin kustannukset ovat pudonneet $600/genomi. Tämä on 5,000,000‑kertainen kustannusten aleneminen! Ja ne voivat laskea jopa $200.

Tämä on täysin muuttanut tapaamme lähestyä genomiikkaa lääketieteellisestä näkökulmasta. Se mahdollistaa valtavan määrän datan luomisen ja analysoinnin, ja jokaisella ihmisellä voi olla pääsy edistyneeseen henkilökohtaiseen lääketieteeseen, joka vastaa hänen ainutlaatuista geneettistä koostumustaan.

Kun genomiikka muuttuu peruslääkinnälliseksi palveluksi, genomin sekvensointiyritykset hyötyvät nopeasti kasvavasta markkinasta ja monista sovelluksista, ravinnosta ja ikääntymisen ehkäisystä varhaiseen syöpädiagnostiikkaan.

Ja näin ei pääty. Sama teknologia, jota käytettiin genomin DNA:n sekvensointiin, voidaan myös käyttää luomaan kokonaan uusia tieteellisiä aloja:

• Metagenomiikka: suoliston bakteerien genomin sekvensointi, mikä vaikuttaa merkittävästi terveyteemme.
• Transkriptomit & Epigenetiikka: jos genomi on rakennuspiirustus, transkriptomit ovat tapa, jolla piirustus otetaan käyttöön käytännössä ja reaaliajassa. Tämä tulee todennäköisesti olemaan erittäin merkittävää monien parantumattomien sairauksien ja aineenvaihduntaongelmien ratkaisemisessa.
• Agrigenomiikka: genomiikan hyödyntäminen maatalouden satojen ja karjan tuottavuuden parantamiseksi.
• Ekologiset tutkimukset: ekosysteemin terveyden tarkka arviointi ja geneettinen monimuotoisuus.
• Synteettinen biologia: uusien geenien, ominaisuuksien tai kokonaan uusien organismien luominen erityistarkoitukseen: esimerkiksi muovia syöviä bakteereja tai biopolttoainetta tuottavia levää.

Lähde: PacBio

5 Parasta Genomin Sekvensointiyritystä / Osakkeet

Tämä artikkeli kattaa 5 parasta julkisesti noteerattua genomin sekvensointiyritystä. Se ei kata yhtä merkittäviä, mutta yksityisiä yrityksiä kuten Ultima Genomics tai Chinese MGI. 

1. Illumina, Inc.

Illumina on genomisen alan johtava yritys, selvästi suurin ja vakiintunein alalla, jonka liikevaihto on $1,2B ja joka on kasvanut 11 % CAGR viimeisten 5 vuoden aikana.

Lähde: Illumina

Kuten useimmat genomin sekvensointiyritykset, Illumina ansaitsee rahaa myymällä sekvensointilaitteita, mutta enimmäkseen kulutustarvikkeita, joita laitteet käyttävät, ja koneen tuotto per laite yleensä kasvaa ajan myötä, kun sitä käytetään täysimääräisesti.

Yrityksen uusi genomin sekvensointimalli, NovaSeqX, on menestys, 109 toimitusta Q2 2023 ja odotettavissa 390 toimitusta vuodelle 2023. Tämä on nopeuttanut massasekvensoinnin omaksumista Illuminan asiakkaiden keskuudessa, lisäämällä mon-omisia analyysejä (useiden “‑omics” -tekniikoiden yhdistämistä) ja laajentaen mittakaavaa yksisolu- ja spatiaalianalyyseissä.

Kun puhutaan Illuminasta, on tarpeen selittää uusi genominen sovellus, syöpädiagnostiikka verinäytteestä, jota kutsutaan nestebioopsiksi. Illumina kehitti tätä teknologiaa ja myöhemmin spin-offi sen yritykseksi nimeltä Grail.

Grail on erittäin menestynyt sekä teknisesti että kaupallisesti, 7 500 tarjoajaa määrää Grailin testejä ja se ylitti 100 000 testin rajan Q2 2023. Se havaitsi myös 92 % syöpärelapsista kuudessa eri verisyövässä.

Muutaman vuoden kuluttua Illumina aikoi ostaa tämän yrityksen takaisin paljon korkeammalla hinnalla.

Tämä aiheutti useita ongelmia. Ensin Yhdysvaltojen ja EU:n sääntelyviranomaiset nostivat huolen monopoliriskistä, sillä Illumina on monien Grailin kilpailijoiden genomin sekvensointilaitteiden toimittaja.

Tämä johti EU:n antamaan €432 M sakkoon. Jos tämä oston estävä päätös ei ratkea, “Illumina myy Grailin vuoden sisällä, jos se ei voita EU:n oikeudenkäyntiä.”

Lähde: Illumina

Toinen ongelma syntyi Grailin kalliista spin-offista, rahoituksesta ja sen takaisinostosta Illuminaan.

Aktivistinen sijoittaja Carl Icahn on hyökännyt yrityksen hallituksen kimppuun ja vihjannut, että mahdollisesti vilpillisiä tai pahantahtoisia toimia on tehty sisäpiiriläisten hyväksi yrityksen osakkeenomistajien kustannuksella. SEC tutkii myös asiaa.

Toistaiseksi toimitusjohtaja on vaihtunut, toinen hallituksen jäsen on eronnut, 4 uutta hallituksen jäsentä on nimitetty, ja Illumina on julkaissut “Stewardship-Focused Update“. Lisätietoa näistä epäilyistä ja syytöksistä löytyy tässä sarjassa Non-GAAP investing -artikkelissa.

Yrityksen osake on pudonnut jyrkästi heinäkuun 2021 huippulukemista lähes 80 %, palaten vuoden 2013 tasolle.

Tämä on melko järkyttävä tilanne suurelle ja vakiintuneelle yritykselle kuten Illumina, riippumatta siitä, kuinka totta nämä syytökset ovat, sillä se heijastaa huonosti yrityksen johdon päätöstä myydä Grail alun perin. Vähintäänkin tämä on osoittautunut kalliiksi virheeksi.

Sijoittajat haluavat arvioida, ovatko he valmiita seuraamaan Carl Icahnia, legendaarista ja kiistanalaista aktivistista sijoittajaa, jolla on vaikuttava historia. Ja onko viime vuosien huono hallinto nyt täysin hinnoiteltu, ja onko se mahdollisesti vahingoittanut yrityksen arvostusta liiallisesti.

2. 10x Genomics, Inc.

10x Genomics (TXG ) on spatiaalibiologian johtaja, joka tutkii genomia ja transkriptomia 3D‑tilassa, mahdollistaen geenien toiminnan visualisoinnin solutasolla tai jopa solunsisäisesti.

Yritys perustettiin vuonna 2012, ja sen perustajina oli muun muassa Serge Saxonov, joka toimi 23andMe ‑yrityksen henkilökohtaisen genomitestin R&D‑johtajana.

10x Genomics kasvoi yhdistämällä R&D‑investointeja ($1 B+ tähän mennessä) ja yritysostoksia. Merkittävästi sen Visium‑alusta hankittiin Spatial Transcriptomics -yrityksestä vuonna 2018.

Lähde: 10x Genomics: 10x Genomics acquisitions timeline

Tämä on myös se tapa, jolla 10x Genomics hankki Xenium ‑alustan ostamalla Readcoor- ja Cartana-yritykset vuonna 2020.

Vuonna 2020 se lanseerasi myös Chromium‑alustan, jonka vuoden jälkeen päivitettiin Chromium X:ksi.

Ostamalla Tetramer Shopin vuonna 2021, 10x Genomics lanseerasi myös BEAM (Barcode Enabled Antigen Mapping) vuonna 2022. Se mahdollistaa tutkijoille immuunijärjestelmän komponenttien yksityiskohtaisen tunnistamisen. Tämä voi olla erittäin vaikuttavaa immuniteettitutkimuksessa ja uusien tautien tutkimuksessa.

Liikevaihto kasvoi 17 % vuodesta toiseen Q2 2023, Xenium‑myynnin johdosta, kun 100‑yksikön myyntiraja ylitettiin elokuussa 2023.

Yritys myös voitti syyskuussa 2023 kriittisen voiton pääkilpailijansa Nanostringia vastaan. Nanostring on toistaiseksi kielletty myymästä CosMx Spatial Molecular Imager (SMI) -laitteitaan suurimmassa osassa EU:ta patenttirikkomusten takia.

Yritys on edelleen varhaisessa vaiheessa, hieman samankaltainen kuin Illumina varhaisina aikoinaan. Tällä hetkellä spatiaalibiologia on rajoittunut akateemiseen ja perustutkimukseen. Kuten monet bioteknologiat, se saattaa joskus laajentua laajamittaiseksi lääketieteelliseksi työkaluksi ja lopulta “rutiinitestiksi”. Joka tapauksessa asennettujen laitteiden määrä kasvattaa kulutustarvikkeiden myyntiä ja liikevaihdon kasvua.

3. Oxford Nanopore Technologies plc (ONT.L)

Oxford Nanopore käyttää ainutlaatuista genomin sekvensointiteknologiaa, joka perustuu virtauskennoihin. Tämä mahdollistaa DNA:n “lukemisen” kun se kulkee nanoporeiden läpi, ei kemiallisesti vaan suoraan mittaamalla sähkövirtaa. Toisin sanoen, tämä on ensimmäinen kerta, kun tietokone voi lukea geneettisen sekvenssin (DNA & RNA) reaaliajassa.

Lähde: Oxford Nanopore

Toinen ainutlaatuinen etu yrityksen teknologiassa on, että se pystyy lukemaan pidempiä geneettisiä sekvenssejä kuin perinteiset sekvensointimenetelmät. Pitkät sekvenssit ja reaaliaikainen lukeminen voivat tuottaa parempia ja nopeampia tuloksia, mikä on tärkeää syöpäanalyysissä tai infektiotautien, kuten antibioottiresistenttien bakteerien, tutkimuksessa.

Lopuksi, sähköinen mittaus mahdollistaa pienemmät ja kannettavammat sekvensointilaitteet, parannuksen massiivisiin koneisiin verrattuna, joita tähän asti on käytetty. Tämä antaa yritykselle mahdollisuuden tuottaa laajan valikoiman sekvensointilaitteita, mukaan lukien hitaammat, pienemmät ja paljon edullisemmat laitteet, alkaen $1 000. Tämä voisi radikaalisti laajentaa sekvensointimarkkinoita, kun mobiili- tai alhaisen kustannuksen sekvensointi ei aiemmin ollut vaihtoehto.

Oxford Nanoporen liikevaihto kasvoi 46 % CAGR viimeisten 4 vuoden aikana, kiitos 7 300 asiakkaan Q2 2023, joista 640 hankittiin viimeisen 12 kuukauden aikana.

Lähde: Oxford Nanopore

Radikaalin uuden teknologiansa vuoksi on epäselvää, missä Oxford sijoittuu kypsämmässä genomin sekvensointiekosysteemissä.

Se voisi täysin korvata vallitsevan kemiallisten/optisten genomien lukemisen teknologian.

Tai se voisi kehittyä menestyväksi, mutta kapean kohdealueen sovellukseksi pienivolyymiselle tai mobiilille sekvensoinnille tai sekvensoinnille, joka vaatii erittäin tarkan pitkien geneettisten sekvenssien lukemisen.

Yritys suunnittelee myös laajentavansa proteiinien, proteiinien post-translationaalisten modifikaatioiden tai pienimolekyylien lukemiseen sekä muihin elämän tieteiden äärirajoihin.

4. Pacific Biosciences of California, Inc.

Aloitettu muutama vuosi Illuminan jälkeen, PacBio on ollut pienempi toimija genomin sekvensoinnissa siitä lähtien. Pienestä koosta huolimatta yrityksen laitteet ovat pysyneet huippuluokan suorituskyvyssä.

PacBio hankki hiljattain Omniomen vuonna 2021, mikä antoi sille etulyöntiaseman tarkkuudessa erittäin pitkien tai lyhyiden geneettisten sekvenssien lukemisessa. Tämä etu vahvistui myöhemmin Aptonin hankinnalla $110 M elokuussa 2023, joka myös erikoistui lyhytlukemiseen, suuriin läpimenoihin (SR‑HI).

Lähde: PacBio

PacBon Onso -järjestelmät alkavat nyt lähteä lähetettäväksi asiakkaille, ja niiden lanseerausta yritys on kuvannut “parhaaksi aloitukseksi PacBon historiassa”. Ne keskittyvät lyhyisiin sekvensseihin, kun taas Revio HiFi -järjestelmä pystyy lukemaan pitkiä sekvenssejä ja toimimaan 24/7, jolloin se lukee 1 300 täyttä ihmisen genomiä vuodessa (noin 4/päivä). Myöhemmin Revio HiFi korvataan HT SBB -järjestelmällä, joka todennäköisesti integroi Apton‑teknologian.

PacBio odottaa pitkien sekvenssien kasvavan paljon nopeammin kuin laajempi NGS‑markkina ja väittää, että sen järjestelmät ovat 10‑kerta tarkempia kuin kilpailijat.

Lähde: PacBio

Kiinnostavaa on, että se voisi myös alentaa genomin sekvensoinnin kokonaiskustannuksia. Lyhyet sekvenssit täytyy koota kokonaiseksi ilman liiallista teknistä monimutkaisuutta. Näin $500 lyhytlukemisen genomi voi nopeasti vaatia lisäanalyysejä, jotka maksavat $1 000, jotta siitä tulee diagnostisesti käyttökelpoinen.

Joten $950 Revio‑pitkäsekvenssianalyysi, ollen tarkempi, välttää tämän vaiheen ja tulee edullisemmaksi diagnostisessa sovelluksessa.

PacBon keskittyminen tarkkaan/pitkiin sekvenssianalyyseihin pitäisi antaa sille etulyöntiaseman diagnostiikassa seuraavien vuosien aikana. PacBon johto uskoo, että tämä voi nostaa yrityksen markkinaosuutta ihmisen genomissa 5 %:sta 10 %:iin ja onkologiassa (syöpä) 1 %:sta 5 %:iin.

Vaikka PacBio keskittyy pitkälti vuosikymmeniä kestäneeseen kilpailuun Illuminan kanssa, sen on myös saatava kilpailla Oxford Nanoporen kanssa diagnostiikka/pitkien sekvenssien markkinoilla.

Historiansa perusteella PacBio on ollut Illuminaa pienempi kilpailija, vähän aloitusyrityksen roolissa, eikä uusi “jännittävä” startup. Tämä ei kuitenkaan tarkoita, että se ei olisi kilpailukykyinen, ja jos se onnistuu valloittamaan nykyisen erikoistuneen markkinansa, se voi positiivisesti yllättää markkinat erottumalla historiallisesta kilpailijastaan.

5. NanoString Technologies, Inc.

NanoString perustettiin vuonna 2003 hyödyntämään Seattle Institute for Systems Biologyssa keksittyä digitaalista molekyylipalkkikoodaus­tekniikkaa.

Lähde: NanoString

Vuoteen 2008 mennessä se lanseerasi ensimmäisen tuotteensa, nCounter, mikä oli suuri edistysaskel transkriptomiikassa (mRNA:n tutkimus). nCounter kantoi yritystä eteenpäin, kun se kehitti seuraavat askeleet. Vuonna 2019 se lanseerasi GeoMx, jota seurasivat CosMx ja digitaalinen alusta AtoMX.

GeoMx on suunniteltu tutkimaan RNA‑ilmentymistä koko kudoksissa ja se voi myös analysoida 150+ proteiinia, enemmän kohteita kuin 10x:n Xenium. CosMx Single Molecular Imager (SMI) puolestaan tarkastelee yksittäistä solua ja sen sisäisiä RNA‑ ja jopa 64 proteiinikohdetta, mahdollisesti jopa 120 kohdetta vuonna 2024.

Lähde: NanoString

NanoString oli keskeinen tekijä spatiaalibiologian tieteellisten julkaisujen räjähdyksessä. Yli 7 117 julkaisua mainitsee NanoString‑laitteet eri aloilta, kuten syöpätutkimus, infektiotaudit (mukaan lukien COVID‑19), immunologia, maatalous tai neurologia.

NanoString on mukana karheassa oikeusriidassa 10x Genomicsin kanssa. EU:n patenttirekisterin äskettäinen tuomio vaikuttaisi 10 %:iin NanoStringistä, jos yritys ei voita valitustaan. Joten vaikka se ei ole elämänloppuratkaisu, se on silti huono uutinen nuorelle yritykselle, jolla on negatiivinen kassavirta.

Markkinat ovat selvästi huolissaan NanoStringin pitkän aikavälin elinkelpoisuudesta, osake on alle $2/osake, alhaalla huippulukemasta $79 vuonna 2021, ja sen IPO‑hinta oli $9,1/osake vuonna 2013.

Sijoittajat haluavat arvioida yrityksen suunnitelmia saavuttaa kannattavuus vuonna 2025 ja päättää, onko hinnanlasku liiallinen ja edustaa mahdollisuutta, ottaen huomioon että yritys on vähentänyt kassankulutuksensa 50 % Q3 2023 aikana.