New England Biolabs Meluncurkan Enzim Riset MB-CasFire dari Mammoth

Pada 10 November 2026, New England Biolabs (NEB) mengumumkan perjanjian lisensi global dengan Mammoth Biosciences untuk memproduksi dan mengomersialkan MB-CasFire, sehingga enzim CRISPR ini langsung tersedia di seluruh dunia untuk keperluan riset melalui NEB dan jaringan distribusinya.

Daftar produk NEB mencantumkan harga katalog $98 untuk M0670S, kemasan 0,1 mililiter yang berisi 500 pmol enzim. Dalam daftar tersebut, penggunaan MB-CasFire dibatasi untuk keperluan riset dan dinyatakan tidak ditujukan untuk penggunaan terapeutik atau diagnostik pada manusia maupun hewan. NEB menangani produksi dan komersialisasi global produk riset ini, sedangkan pertanyaan tentang lisensi penggunaan komersial diarahkan kepada Mammoth.

Format Satu Reaksi Menggabungkan Amplifikasi dan Deteksi

MB-CasFire adalah nuklease CRISPR tipe V hasil rekayasa yang termostabil dan dipandu oleh satu RNA pemandu. Aktivitasnya pada suhu 37°C hingga 65°C memungkinkannya bekerja bersama amplifikasi isotermal, yang menggandakan asam nukleat pada suhu konstan. Enzim ini dapat dipadukan dengan amplifikasi isotermal yang dimediasi loop (LAMP) pada suhu 50°C hingga 65°C dan amplifikasi polimerase rekombinase (RPA) pada suhu 37°C hingga 42°C.

Penggabungan amplifikasi dan pemotongan reporter oleh CRISPR dalam satu reaksi menghilangkan tahapan inkubasi pada suhu terpisah dan penambahan komponen secara terpisah. Cara ini juga menambahkan lapisan pengenalan kedua: setelah amplifikasi, RNA pemandu harus mengenali urutan yang dituju sebelum enzim aktif dan memotong reporter. NEB dan Mammoth menyatakan bahwa pendekatan ini mengatasi amplifikasi latar belakang nonspesifik yang dapat memengaruhi alur kerja RPA cepat dan reaksi amplifikasi enzim pemotong untai tunggal (NEAR).

“Para pengembang ingin menggabungkan kecepatan metode-metode ini dengan ketepatan CRISPR, tetapi alur kerjanya sering kali terlalu rumit,” kata Nathan Tanner, direktur asosiasi riset biologi molekuler terapan di NEB.

NEB menetapkan penggunaan RNA pemandu sepanjang 40 nukleotida dan motif yang berdekatan dengan protospacer 5′ YYN pada untai DNA yang berlawanan dengan urutan target. Dalam eksperimen satu nukleotida yang dilakukan NEB sendiri, sinyal LAMP saja tidak dapat membedakan templat tipe liar dari templat mutan, sedangkan kompleks RNA pemandu spesifik target–MB-CasFire dapat membedakannya. Templat tersebut membawa urutan gyrA tipe liar atau perubahan C-ke-T S91F yang terkait dengan resistansi terhadap siprofloksasin pada Neisseria gonorrhoeae.

Pracetak Melaporkan Perbandingan dengan Sampel Klinis

Naskah pendukung yang diunggah di medRxiv pada 9 November 2026 menjelaskan bagaimana para peneliti Mammoth menemukan Cas12a alami yang termostabil melalui penelusuran basis data metagenomik yang berisi lebih dari 35 miliar urutan protein, lalu merekayasanya agar lebih termostabil dan kompatibel dengan penyangga amplifikasi isotermal. Naskah tersebut merupakan pracetak yang belum disertifikasi melalui penelaahan sejawat. Para penulisnya tercatat berafiliasi dengan Mammoth Biosciences.

Dalam eksperimen SARS-CoV-2, para peneliti melaporkan bahwa OnePot DETECTR berbasis LAMP mendeteksi seluruh 20 ulangan pada 50 salinan per reaksi, dibandingkan dengan 15 dari 20 pada 25 salinan dan tujuh dari 20 pada 10 salinan. Dalam pengujian sampel usap nasofaring klinis, setelah mengecualikan dua sampel yang hasilnya negatif untuk kontrol RNase P maupun SARS-CoV-2 menurut metode pembanding, uji tersebut menunjukkan kesesuaian persentase positif sebesar 94,1% (32 dari 34 sampel) dan kesesuaian persentase negatif sebesar 100% (36 dari 36) dibandingkan dengan RT-qPCR.

Untuk Neisseria gonorrhoeae, para peneliti melaporkan bahwa OnePot DETECTR berbasis NEAR mendeteksi 17 dari 19 spesimen urine yang positif menurut metode rujukan, dibandingkan dengan 14 dari 19 menggunakan pembacaan molekul berbasis suar dengan primer dan kondisi penyangga yang sama. Kedua metode mengklasifikasikan dengan benar seluruh 34 spesimen yang negatif menurut metode rujukan. Dalam eksperimen terpisah, uji pemandu MB-CasFire menentukan genotipe S91/S91F pada gyrA dari 11 galur rujukan dengan kesesuaian 100% dalam 20 menit, yang menunjukkan kemampuan membedakan satu nukleotida dalam eksperimen tersebut.

Dengan demikian, peluncuran ini menyediakan jalur pasokan komersial untuk deteksi CRISPR dalam satu reaksi, bukan produk diagnostik klinis. Artinya, dalam waktu dekat bisnisnya tetap berfokus pada perangkat riset: NEB memasok enzim dan menyediakan jaringan distribusi, Mammoth menangani pertanyaan terpisah mengenai lisensi penggunaan komersial, dan para pengembang dapat menilai hasil perbandingan dalam pracetak saat mengembangkan uji mereka sendiri.