Öne Çıkanlar
Ginkgo Bioworks (DNA): Talep Üzerine Yaşam İnşa Etmek

Biyoteknoloji İçin Yeni Bir Dönem
Zaman içinde, tıp ve biyoteknoloji konusundaki bilgi, ardışık önemli aşamalarda değişti. Başlangıçta, çoğunlukla doğal biyokimyasal süreçlerin anlaşılmasıyla ilgiliydi. Ardından, sentetik kimyasal ilaçlar bu süreçleri değiştirmeye başladı. Daha sonra, biyomühendislik, GMO mikroplar aracılığıyla ucuz ve güvenli insülin, büyüme hormonu vb. üretimine olanak sağladı.
Bugün, birçok teknoloji bir araya gelerek biyobilimlerde başka bir dönemi açıyor: Büyük veri, yapay zeka, otomasyon, hassas genetik mühendisliği, gelişmiş analizler vb.
Yeni tasarlanan organizmalar ve terapiler aşaması, doğanın yarattığını sadece düzeltmek ya da kopyalamakla kalmıyor, aynı zamanda sıfırdan tamamen yeni yetenekler yaratıyor. Bu, modern dünyanın çoğu sorununu çözmek için radikal bir yeni araç olabilir: plastik kirliliği, iklim değişikliği, sürdürülebilir tarım, kirletmeyen endüstriyel üretim, biyogüvenlik, tedavi edilemeyen hastalıklar, rejeneratif tıp, uzun ömür tedavileri vb.
Bu tamamen yeni teknoloji yığınına, zaten karmaşık olan tıbbi araştırma, klinik denemeler veya endüstriyel tesis düzenlemelerinin üzerine ek olarak, hâkim olmak zor olabilir, hatta sektör liderleri için bile.
Bu yüzden, “Araştırma‑hizmet‑olarak” veya “isteğe‑göre‑organizmalar” gibi yeni hizmet biçimleriyle uzmanlıklarını sunan özel şirketler ortaya çıkıyor. Ve bu yükselen sektörü yöneten şirket Ginkgo Bioworks (DNA ).
DNA Fiyat Grafiği
Ginkgo Bioworks’un Kökenleri
Şirket, 2008 yılında beş MIT bilim insanı tarafından, endüstriyel uygulamalar için GMO bakteri üretmek amacıyla kuruldu. Temel fikir, modifiye mikroorganizmalar kullanan çoğu projenin kullanılabilir bir ürün elde etmeden önce aynı adımları ayrı ayrı tekrarlamak zorunda olmasıydı.
Bunun yerine, Ginkgo gibi bir şirket bu adımları bir kez gerçekleştirip, ortak bu teknolojik ve biyolojik temelden birden fazla ürünü lisanslayabilir.
Think of a cell. It’s kind of like a little machine that runs on digital code, very similar to a computer, except in this case the code—instead of zeros and ones, it’s A’s, T’s, C’s, and G’s.
So synthetic biology is programming cells like we program computers, by changing the DNA code inside them. We’re sort of like cell programmers for hire. Our job is to make the cell do what our customers want.
Ginkgo, 2014 yılında ünlü Y Combinator girişim hızlandırma programına katılan ilk biyoteknoloji şirketiydi ve bir dönem dünyanın en büyük özel biyotek şirketlerinden biri olarak, 2019 yılında 4,2 milyar dolar değerindeydi.
Şirket, 2021’de bir SPAC birleşmesiyle halka açıldı ve daha önce biyoteknoloji öncüsü Genentech’e (Roche tarafından satın alınmadan önce) ait olan NYSE DNA hisse kodunu elde etti.
Ginkgo’nun Benzersiz Hizmetleri ve Altyapısı
Ginkgo Otomasyonu
Ginkgo’nun özgün satış noktalarından biri, biyolojik verileri otomatik ve tutarlı bir şekilde üretmesiydi.
Bu, biyoteknoloji için kritik bir gelişmedir; çünkü tekrarlanması veya karşılaştırılması zor çalışmalar sektörü rahatsız etmiş ve bilimsel keşifleri sistemleştirme girişimleri belirsiz kalmıştır.
Otomasyon, doktora seviyesindeki araştırmacıların zahmetli ve yavaş manuel çalışması yerine, maliyet kontrolünü sağlamak için de gereklidir.
Bu sorunları çözmek için şirket, robotik kollar, kablosuz bağlantı ve modüler analiz cihaz yuvalarıyla otomatik biyolablar oluşturmak üzere yeniden yapılandırılabilir Otomasyon Arabaları (RACs) adlı modüler bir yapı taşı geliştirdi.

Kaynak: Ginkgo Bioworks
Daha sonra, bilimsel deneyler ve biyolojik analizler için bir çeşit “montaj zinciri” oluşturmak üzere birbirlerine bağlanabilirler.

Kaynak: Ginkgo Bioworks
Bu çözüm, bir yazılım teklifiyle birleştirilerek, yeni projeler için aylar süren maliyetli yeniden yapılandırma gerektiren daha katı araştırma altyapılarına kıyasla, sadece günler ya da saatler içinde uyarlanabilir ve değiştirilebilir esnek bir çözüm sunar.
Ginkgo Veri Noktası
Otomasyon biyolojik verileri üretirken, Veri Noktası bu verileri faydalı içgörülere dönüştürür.
Ana unsur, daha fazla hipotezi yönlendirebilecek verilerin hızlı üretilmesi ve ilerlemeyi sürdürmek için yeni deneylerin hızlı yinelemesidir.

Kaynak: Ginkgo Bioworks
Bu hizmet sayesinde Ginkgo, tamamen müşteriye ait verileri sağlayabilir; bu, diğer biyoteknoloji veya ilaç şirketleriyle ortaklıklara rekabet avantajı sunar.
Veriler, her hücre tipinde on binlerce in vitro kimyasal ve genetik bozulma ile sadece 3 hafta içinde üretilebilir ve sonuçları incelemek için geniş bir analiz yöntemi seçeneği mevcuttur.
Aynı sistem, onkoloji ve diğer tıp alanlarında hızla kilit bir ilaç haline gelen yeni antikorların hızlı üretilmesi için de kullanılabilir. Ginkgo, 1 milyar dolarlık otomatik ıslak laboratuvar altyapısı sayesinde paralel olarak 2.400 farklı antikoru tarayabilir.

Kaynak: Ginkgo Bioworks
Son olarak, bu teknoloji yeni mRNA dizilerini çok hızlı bir şekilde üretmek ve test etmek için de kullanılabilir.

Kaynak: Ginkgo Bioworks
Genel olarak, bu veriler biyoteknoloji araştırmalarına özel AI ajanlarını eğitmek için kullanılabilir; bu doğrudan Ginkgo tarafından ya da sınırsız veri erişimi için ödeme yapmaya hazır olan müşterileri tarafından yapılabilir. Ya da bu bağlamda, laboratuvarda yetiştirilen ve silikon çiplere bağlanabilen mikro-beyin organoidleriyle AI’nın daha enerji verimli hesaplamasına yardımcı olmak gibi bir kullanım da mümkündür.
Ginkgo Bioworks Segmentleri
Özel biyomühendislik organizmaları ve sentetik biyolojinin potansiyeli bu kadar geniş olduğu için, Ginkgo’nun tarım, biyolojik ilaçlar, biyogüvenlik, hükümet programları ve endüstriyel biyoteknoloji gibi çok büyük pazarlarda potansiyeli vardır.
Tarım
Modern tarım, daha sürdürülebilir uygulamalara, istilacı türlere, toprak bozulmasına ve iklim değişikliğine yönelik baskı altında olduğundan, yeni ürün çeşitlerine yüksek talep vardır.
Şirket, kendi sera tesisini işletmekte ve 387.000’den fazla agronomik bitki suşuna, ayrıca kamu gen veri tabanlarıyla neredeyse hiç örtüşmeyen 2,7 milyar gen içeren özel bir metagenomik veritabanına erişime sahiptir.
Bu segmentin odak noktası, mahsul koruması (zararlılar ve hastalıklara karşı), mahsul beslenmesi (gübre optimizasyonu) ve bitki özellikleri (büyüme hızı, verim, su veya ısı stresine direnç vb.) arasında bölünmüştür.
Ginkgo’nun ürünleri, kimyasal tedaviler gerektiren zararlılar için biyokontrol oluşturarak mahsulleri korur; örneğin Vitales ile ortaklıkBrezilya’da kritik soya fasulyesi hastalıklarını kontrol etmek.
“Ginkgo ile ortaklık, hayati yeni biyokontrol çözümlerini piyasaya sürme zaman çizelgemizi hızlandırmamızı sağlıyor. Ginkgo’nun fermantasyon ve formülasyon konusundaki uzmanlığı, aynı çatı altında iş birliği yapan ekiplerle, ekonomik açıdan uygulanabilir ürün konseptlerinin geliştirilmesini hızlandıracaktır.”
Fernando Eduardo Alves de Sousa – Biological Sciences, Vitales
Ginkgo’nun tarım işindeki müşteri listesi, Bayer ve Syngenta gibi küresel lider firmaları içerir.
Bayer ile ortaklık, azot gübrelerini bakterilerle değiştirmeyi hedefliyor; azot gübresi, dünya genelinde kullanılan doğal gazın %5’ini tüketir ve küresel sera gazı emisyonlarının %3’ünden sorumludur.
Biyofarma
Biyoteknoloji sektörünün en büyük kazanç sağlayıcılarından biri olarak, biyofarma sektörü Ginkgo için çok önemlidir. Şirket, Pfizer (PFE ), Novo Nordisk, Biogen, Moderna ve Boehringer Ingelheim gibi etkileyici bir büyük ilaç şirketleri listesiyle ilişkiler kurmuştur.
“Ginkgo’nun hücre programlama uzmanlığı, özel araçları ve biyolojik sistemler konusundaki bilgisi, onları ideal bir iş birliği ortağı yapıyor.”
Alphonse Galdes – Fmr. Head of Pharmaceutical Operations & Technology at Biogen
Ortaklık ve hizmetler 6 farklı ana konu etrafında düzenlenmiştir:
- Biyolojik ürünler ve peptitlerin optimize edilmiş üretimi, özellikle Novo Nordisk ve Selecta Biosciences için.
- Aktif farmasötik bileşenlerin (API) üretimi, ölçeklendirilmiş biyokataliz ve fermantasyon aracılığıyla.
- Moleküler tanı çözümleri, özel enzim veri tabanı ve uzman enzim tasarımcıları sayesinde.
- Gen terapisi, gen materyalini iletmek için lipid nanopartiküller ve AAV’lar (viral vektörler) kapsüllerine odaklanarak.
- Hücre terapisi ve gen düzenleme, CAR‑T, CRISPR ve başka bir ileri yöntemle hassas gen düzenleme kullanarak.
- RNA terapötikleri ve aşıları, mRNA ve circRNA dizilerini daha iyi dayanıklılık ve protein ifadesi için optimize ederek, özellikle Moderna ve Pfizer için, ve mRNA veri üretimi AI modellerinden yararlanarak.
“Ginkgo’nun özel platformuna erişim, Pfizer’ın daha iyi stabilite ve ifade sağlayan yeni ve heyecan verici RNA yapıları aramasına yardımcı olacak ve bu da daha etkili tedavilere yol açabilir.”
Will Somers – Head of Biomedicine Design at Pfizer
Son zamanlarda büyüyen kilit ortaklıklardan biri, Novo Nordisk’in 2024’te Ginkgo ile bağlantısını genişletmesidir. 2022’de üretim optimizasyonuna odaklanan iş birliği, artık daha geniş bir alana yayılmayı ve yeni protein bazlı ilaçların keşfi ve geliştirilmesini de kapsıyor.
“Bu ilerleme, biyolojik ilaçların kimyasal alanını genişletecek biyolojik sistemleri mühendislik yapma potansiyelimizin güçlü bir göstergesidir.”
Brian Vandahl – SVP, Global Research Technologie at Novo Nordisk
Bahsedilebilecek diğer Ginkgo araştırma programları ve ortaklıkları şunlardır:
- Kannabinoidler
- Bağırsak hastalıkları için programlanabilir mikroplar
- Mikroplastik biyoremediasyonu
- Atık ve kirleticilerin geri dönüşümü

Kaynak: Ginkgo Bioworks
Biyogüvenlik ve Hükümet
Pandemi sırasında, Ginkgo Covid-19 tespiti için test üretiminde yardımcı oldu; 11 önemli uluslararası havalimanında 15 milyondan fazla örnek test edildi.
Şimdi, anonimleştirilmiş süt örnekleri kullanarak genomik gözetim yoluyla H5N1 (kuş gribi) izleme yapmaktadır.
Şirket, bu görevleri öncelikle iki araç aracılığıyla gerçekleştirir: Horizon ve Canopy.
Horizon
Bu, ilgi alanı coğrafyalar için Yerelleştirilmiş biyointelijans (BIOINT) içeren bir yazılım ve veri tabanı biyolojik raporlama paketidir. Genel amaç, hastaneler, hükümetler, havayolları vb. karar vericilere daha iyi veri sağlamaktır.
Bu, erken uyarı sistemleri, enfeksiyon tahmini ve modellemesi, yüksek riskli merkezlerin belirlenmesi, hazırlık değerlendirmesi ve tedarik yönetimi yoluyla yapılır ve hatta özelleştirilmiş AI’ları eğitmek için kullanılabilir.
Canopy
Canopy, hızlı PCR ile tespit, nesil-ötesi sekanslama ve AI destekli analiz kullanan yerelleştirilmiş bir patojen gözetim sistemidir.
Bu, erken uyarı sağlamak, gerçek zamanlı durumu daha iyi değerlendirmek ve kamu verilerindeki boşlukları doldurmak için tasarlanmıştır.
Horizon ile birlikte, Ginkgo potansiyel pandemileri, devam eden salgınları ve genel biyotahditleri daha iyi yönetmeye yardımcı olabilir.
Endüstriyel Biyoteknoloji
Birçok kimyasal ve imalat endüstrisi, büyük miktarlarda toksik ve/veya kirletici malzemelere dayanır ve çok enerji yoğun olabilir. Teorik olarak, bunların çoğu mikroorganizmaların, bitkilerin veya izole enzimlerin biyokimyasal yetenekleriyle değiştirilebilir.
Ginkgo şu anda sektörde renk maddeleri, aromalar, parfümler vb. üreten Givaudan, Robertet veya Solvay gibi önemli şirketlerle ortaklık yapmaktadır.
Bu, kimyasal veya metal katalizörleri biyokatalizörlerle değiştirebilir, yapay bileşenleri doğal olanlarla değiştirebilir veya fonksiyonel proteinleri daha ucuz ve güvenilir bir şekilde üretebilir.
Ginkgo’nun İş Modeli Belirsizliği
Kayda değer teknik başarılarına rağmen, Ginkgo yatırım ve hisse fiyatı açısından zorluklar yaşamaktadır.
Bu, büyük ölçüde benzersiz iş modelinden kaynaklanıyordu; birçok kişi, bu modelin 2021’deki çok yüksek değerlemesini (pandemi sırasında tüm biyoteknoloji sektörünün genel yüksek değerlemesiyle daha da şişirilmişti) haklı çıkaracak kadar para getireceğinden şüphe duyuyor.
Ginkgo’nun keşifleri için telif hakkı almaması, anlaşma imzalamada ticari bir avantaj olsa da, uzun vadede bu anlaşmalardan kâr elde etme yeteneğini ciddi şekilde engelleyebilir.
Bu durumu gösteren bazı unsurlar muhtemelen değişmeye başlıyor. İlk olarak, Merck ile bir projede büyük bir kilometre taşının teslim edilmesi, 2024’ün 4. çeyreğinde 9 milyon dolar ödeme yapılmasına yol açtı ve projenin 2. aşamasının başlaması, daha büyük ödemelerin beklenmesi.
Bu, Merck’in biyoyapım sürecinde iyileşmeye yol açacağı için, Ginkgo’nun ileride daha fazla gelir elde etmesi muhtemeldir. Daha önce bahsedilen insülin devi ve Ozempic ünlüsü Novo Nordisk ile iş birliğinin genişlemesi de önemli olacaktır.

Kaynak: Ginkgo Bioworks
Toplamda, şirketin aşağı yönlü kilometre taşı havuzunda 1,7 milyar dolar kadar potansiyel gelecek nakit geliri bulunmaktadır.
Şirket ayrıca, hem kamu hem de özel laboratuvarlardaki araştırmacılara araçlarını doğrudan satmakta; bu, ortaklardan gelen düzensiz kilometre taşı ödemelerinden daha istikrarlı olabilecek (gelecek bakım, güncelleme ve sarf malzemeleri satışları dahil) başka bir gelir akışı yaratmaktadır.
Genel olarak, biyogüvenlik gelirleri pandemi sonrası dönemde azalıyor ancak hücre mühendisliği sözleşmeleriyle yer değiştiriyor.

Kaynak: Ginkgo Bioworks
Yeniden Yapılandırma
Şirketin finansal durumunu iyileştirmek için bir diğer unsur, genel giderleri azaltmaktır. 2024’te, çalışanlar ve ofis/laboratuvar alanı dışındaki maliyetleri agresif bir şekilde azaltarak çeyrek harcamaları neredeyse 150 milyon dolar düşürmüştür.

Kaynak: Ginkgo Bioworks
Ayrıca, genişleme ve çeşitli satın almalar sonucunda birikmiş çoklu tesislerini birleştiriyor; Avrupa’da sadece bir tesis, ABD’de 3 tesis kalmıştır. Çoklu binalara yayılmış faaliyetlerin birleştirilmesi de yakında gerçekleşecektir.

Kaynak: Ginkgo Bioworks
Ginkgo’nun Gelecek İş Modeli
Bir ölçüde, şirketin yatırımcıları geri kazanmak için iş modelinde ek bir geçiş yapması muhtemeldir.
Biri, otomatik laboratuvarları araştırmacılara satma yoluyla başlatılmış, daha çok bu tesisler aracılığıyla faaliyet gösteren bir yönün, daha donanım odaklı bir yönelime geçiş olabilir.
Başka bir seçenek, Ginkgo’nun ölçekli sözleşmeli üretime daha fazla başlaması olabilir. Biyobilimlerdeki, laboratuvar donanım tasarımındaki ve Merck gibi devler için üretim optimizasyonundaki uzmanlığı, bu yolda başarılı olmasını sağlayan ciddi bir referansdır.
Son olarak, şirketin varlıklarının, örneğin otomatik ıslak laboratuvarlardaki milyarlarca dolar değerindeki varlıkların, mevcut piyasa değerlemesinde ciddi bir indirimle $0.5 milyarın altında olduğu belirtilmelidir.
Sadece fikri mülkiyet ağırlıklı bir şirket olmaktan çok uzakta, Ginkgo’nun faaliyetlerini destekleyecek sağlam fiziksel varlıkları da var ve bunların herhangi bir rakip tarafından taklit edilmesi zor olacaktır.
Sonuç
Ginkgo Bioworks, sentetik biyolojide bir öncüdür; sektörde neredeyse iki on yıl önce erken bir hamle yapmıştır.
Teknik açıdan bakıldığında, biyolojik verilerin üretilmesi, analiz edilmesi ve faydalı uygulamalara dönüştürülmesi şeklini devrim niteliğinde değiştirmekte ve hâlâ değiştirmektedir. Bu, tarım, tıp, biyoteknoloji ve biyoproduktlerin endüstriyel kullanımında geniş kapsamlı sonuçlar doğurmaktadır.
Ayrıca, şirket kendi iyiliği ve 2021’de hisse senedini zirvede satın alan yatırımcılar için çok hırslı olmuş olabilir. İşin yeterli nakit üretmesini hızlı bir şekilde sağlamakta yaşanan zorluk, endişelere yol açmış ve şirketin hisse fiyatlarının çöküşüyle yansıtılan kalıcı bir krize neden olmuştur.
Buna rağmen, Ginkgo Bioworks, en büyük ilaç şirketlerinin çoğu için kilit bir ortak haline gelmiştir; hiçbirinin, muhtemelen bir rakibi tarafından satın alınacak bir iflas durumuna ilgi göstermediği bir gerçektir.
Bu basit gerçek, iş modeli ve maliyet yapılarındaki değişikliklerle birleştiğinde, şirkete yeni bir büyüme rotası sağlayacak ve onu daha sürdürülebilir, biyoloji odaklı yeni bir yüzyılın merkezi bir taşı taşıyıcısı haline getirecektir.











