Εταιρείες και ερευνητικά ιδρύματα γύρω από την Τζένιφερ Ντούντνα: επισκόπηση Μαΐου 2023

Η Επανάσταση CRISPR

Αυτή η επισκόπηση του Μαΐου 2023 παρουσιάζει εταιρείες και ερευνητικά ιδρύματα που συνδέονται με την Τζένιφερ Ντούντνα. Οι χρηματοδοτήσεις, τα προγράμματα και οι προβλέψεις αφορούν εκείνη την ιστορική περίοδο. Νέες βιοτεχνολογικές μέθοδοι μπορούν να ανοίξουν σημαντικές δυνατότητες στην παραγωγή, την έρευνα και την ιατρική.

Το 2012, η Τζένιφερ Ντούντνα, η Εμανουέλ Σαρπαντιέ και οι συνεργάτες τους έδειξαν πώς το CRISPR-Cas9 μπορεί να προγραμματιστεί για να κόβει συγκεκριμένες αλληλουχίες DNA, θεμελιώνοντας μια σημαντική μέθοδο γονιδιωματικής επεξεργασίας. Για την ανάπτυξη αυτής της μεθόδου, οι δύο ερευνήτριες έλαβαν το Νόμπελ Χημείας το 2020.

Το CRISPR σημαίνει Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats. Εταιρείες ερευνούν τη γονιδιακή επεξεργασία για τη θεραπεία ασθενειών και τη δημιουργία νέων ιδιοτήτων σε φυτά, μικροοργανισμούς και ζώα.

Η Ντούντνα έχει σημαντικό ρόλο σε αυτή την εξέλιξη, η οποία βασίζεται στο έργο πολλών ερευνητών.

Jennifer Doudna

Η Τζένιφερ Ντούντνα είναι Αμερικανίδα μοριακή βιολόγος στο Πανεπιστήμιο της Καλιφόρνιας στο Μπέρκλεϊ. Η πρώιμη έρευνά της επικεντρώθηκε στο RNA.

Η Εμανουέλ Σαρπαντιέ ήταν συνιδρύτρια της CRISPR Therapeutics (CRSP ) το 2013. Περισσότερες πληροφορίες υπάρχουν στα άρθρα μας που τη συγκρίνουν με τη Beam Therapeutics (BEAM )  και με την Editas Medicine (EDIT ).

Η Ντούντνα συμμετείχε στην ίδρυση πολλών άλλων εταιρειών, οι οποίες παρουσιάζονται παρακάτω.

Αν θέλετε να μάθετε περισσότερα, μπορείτε να διαβάσετε μια πιο εκτενή βιογραφία της κ. Doudna στη Britannica ή το βιβλίο για τη ζωή της από τον Γουόλτερ Άιζακσον, βιογράφο του Στιβ Τζομπς.

Εταιρείες και ερευνητικά ιδρύματα που συνδέονται με τη Ντούντνα

Η Ντούντνα ήταν μεταξύ των συνιδρυτών των ακόλουθων εταιρειών. Αυτό δεν σημαίνει ότι όλες της ανήκουν ή ότι τις διοικεί καθημερινά:

• Editas Medicine
• Mammoth Biosciences
• Scribe Therapeutics
• Caribou Biosciences

Μετά την αρχική χρηματοδότηση το 2014, το Innovative Genomics Institute (IGI) ξεκίνησε επίσημα το 2015 ως συνεργασία του UC Berkeley με το UC San Francisco, φέρνοντας κοντά ερευνητές από ιδρύματα της Καλιφόρνιας.

Η Ντούντνα συνδέεται επίσης με το Gladstone Institute of Data Science and Biotechnology και με το εργαστήριό της στο Μπέρκλεϊ, όπου διεξάγεται έρευνα για τη γονιδιωματική επεξεργασία και την καταγραφή βιολογικών πληροφοριών μέσω του Κέντρου Γονιδιωματικής Επεξεργασίας και Καταγραφής (CGER).

Η επισκόπηση ανέφερε επίσης συμβουλευτικούς ρόλους στην επενδυτική εταιρεία Sixth Street και στην InvisiShield, που αναπτύσσει ενδορρινικά σκευάσματα για την πρόληψη λοιμώξεων από αναπνευστικούς ιούς.

1. Editas Medicine

EDIT Διάγραμμα τιμής

Η Editas εργάστηκε με το Cas9 και το 2023 έδωσε έμφαση στην τροποποιημένη παραλλαγή AsCas12a του Cas12a. Παράδειγμα ήταν το υπό ανάπτυξη EDIT-301 για αιματολογικές παθήσεις. Στο συγκριτικό άρθρο μας εξετάζουμε χαρακτηριστικά του Cas12a, όπως:

• Διαφορετικές δυνατότητες στόχευσης από το Cas9, χρήσιμες σε ορισμένες εφαρμογές.
• Υψηλή αποτελεσματικότητα επεξεργασίας σε κατάλληλα κύτταρα και εφαρμογές, χωρίς αυτό να εγγυάται ότι υπερέχει πάντα του Cas9.
• Δυνατότητα πολλαπλών ταυτόχρονων επεξεργασιών, την οποία μπορούν να υποστηρίζουν και άλλα συστήματα CRISPR.

Η Editas εστίαζε τότε κυρίως σε αιματολογικές παθήσεις. Τον Ιανουάριο του 2023 ανακοίνωσε συμφωνία μεταβίβασης των προκλινικών προγραμμάτων κυττάρων iNK, μεταξύ τους το ογκολογικό EDIT-202, στη Shoreline Biosciences και αδειοδότησης σχετικών τεχνολογιών. Η εικόνα παρουσιάζει ιστορικό χαρτοφυλάκιο ανάπτυξης.

Διαβάστε περισσότερα για την ιστορία, τα υπό ανάπτυξη προϊόντα και τα οικονομικά της εταιρείας στο αντίστοιχο άρθρο μας.

2. Mammoth Biosciences

Η Mammoth δεν ήταν εισηγμένη το 2023. Η εταιρεία ανακοίνωσε το 2021 χρηματοδοτήσεις συνολικά 195 εκατομμυρίων δολαρίων, με αποτίμηση άνω του 1 δισεκατομμυρίου. Περιλάμβαναν γύρο Series D 150 εκατομμυρίων και προηγούμενο Series C 45 εκατομμυρίων που ολοκληρώθηκε στα τέλη του 2020.

Η εταιρεία παρουσιάστηκε δημόσια το 2018 με σχέδια αξιοποίησης του CRISPR για εύχρηστες διαγνωστικές εξετάσεις, κιτ και εφαρμογή κινητού, με πιθανή χρήση σε νοσοκομεία ή στο σπίτι. Η γρήγορη ανάγνωση, περίπου σε είκοσι λεπτά, ήταν αναπτυξιακός στόχος και όχι γενική εγγύηση για κάθε νόσο ή εγκεκριμένη οικιακή εξέταση.

Η Mammoth ανέπτυσσε και αδειοδοτούσε συστήματα CRISPR για διαγνωστική και γονιδιακή επεξεργασία, μεταξύ τους τα Cas12, Cas13 και τα πολύ μικρά Cas14 και CasPhi. Το επιχειρηματικό της μοντέλο περιλάμβανε έρευνα, θεραπευτική ανάπτυξη και συνεργασίες, πέρα από την αδειοδότηση ευρεσιτεχνιών.

3. Scribe Therapeutics

Scribe Therapeutics (SCTX ) δεν ήταν εισηγμένη το 2023 και ανέπτυσσε τροποποιημένα συστήματα CRISPR. Η εταιρεία άντλησε 100 εκατομμύρια δολάρια σε γύρο Series B το 2021. Η τρέχουσα χρηματιστηριακή ένδειξη δίπλα στο όνομά της αφορά τη μεταγενέστερη εισαγωγή στο Nasdaq με σύμβολο SCTX το 2026.

Η πλατφόρμα X-Editing βασιζόταν στο CasX, μικρότερο από συνηθισμένες παραλλαγές του Cas9. Το μέγεθος μπορεί να διευκολύνει την παράδοση στα κύτταρα, χωρίς να αποδεικνύει από μόνο του καλύτερη αποτελεσματικότητα. Η εταιρεία δημοσιοποιούσε τότε περιορισμένες πληροφορίες για ερευνητικούς τομείς και τεχνικά αποτελέσματα.

Πηγή: Scribe Therapeutics

Το 2020 η Scribe σύναψε συνεργασία με τη Biogen για γενετικά καθοριζόμενη αμυοτροφική πλευρική σκλήρυνση (ALS) και προαιρετικό δεύτερο νευρολογικό στόχο. Περιλάμβανε 15 εκατομμύρια δολάρια προκαταβολικά, πάνω από 400 εκατομμύρια σε δυνητικές πληρωμές αναπτυξιακών και εμπορικών οροσήμων και δικαιώματα επί πωλήσεων. Η συνεργασία επεκτάθηκε το 2022. Τον Σεπτέμβριο του 2022 υπεγράφη επίσης συμφωνία με τη Sanofi (SNW.DE ) (SNY ) για την επεξεργασία κυττάρων φυσικών φονέων (NK) κατά του καρκίνου: 25 εκατομμύρια δολάρια προκαταβολικά, πάνω από 1 δισεκατομμύριο σε δυνητικά ορόσημα και δικαιώματα επί πωλήσεων. Τα μεγάλα ποσά εξαρτώνταν συνεπώς κυρίως από μελλοντικά αποτελέσματα.

4. Caribou Biosciences

CRBU Διάγραμμα τιμής

Η Caribou ιδρύθηκε για την ανάπτυξη τεχνολογιών CRISPR και την εμπορική αξιοποίηση και αδειοδότηση πνευματικής ιδιοκτησίας. Η ιστορική εικόνα αδειοδοτήσεων περιλαμβάνει εταιρείες όπως οι Novartis και Corteva:

Πηγή: Caribou Biosciences

Το 2023 υπήρχε συνεργασία με την AbbVie (ABBV ) για αλλογενείς κυτταρικές θεραπείες CAR-T. Η Caribou ανέπτυσσε επίσης δικά της προγράμματα CAR-T και, τότε, CAR-NK. Η συμφωνία με την AbbVie τερματίστηκε αργότερα μέσα στο 2023.

Η τεχνολογία chRDNA χρησιμοποιεί υβριδικούς οδηγούς RNA-DNA τόσο με Cas9 όσο και με Cas12a για συγκεκριμένες επεξεργασίες και πολλαπλές εισαγωγές γονιδίων. Η εταιρεία ανέφερε σε ορισμένα πειράματα λιγότερη επεξεργασία εκτός στόχου από ό,τι με οδηγούς αποκλειστικά RNA· αυτό δεν αποτελεί καθολική σύγκριση με κάθε παλαιότερη εφαρμογή CRISPR.

Η Caribou ανέφερε 317 εκατομμύρια δολάρια σε διαθέσιμα, ταμειακά ισοδύναμα και εμπορεύσιμους τίτλους στις 31 Δεκεμβρίου 2022. Τον Μάρτιο του 2023 εκτιμούσε ότι θα χρηματοδοτούσαν το τότε λειτουργικό σχέδιο για διάστημα που θα εκτεινόταν στο 2025. Ήταν ιστορική πρόβλεψη, όχι ταμειακό υπόλοιπο Απριλίου 2023 ή εγγύηση επαρκών εσόδων από αδειοδοτήσεις.

5. Innovative Genomics Institute (IGI)

Στις 17 Απριλίου 2023 ανακοινώθηκε για το IGI χρηματοδότηση δωρητών ύψους 70 εκατομμυρίων δολαρίων μέσω του Audacious Project του TED για το ερευνητικό εγχείρημα «Μηχανική του μικροβιώματος με CRISPR για τη βελτίωση του κλίματος και της υγείας μας». Επικεφαλής ήταν η Τζένιφερ Ντούντνα και η Τζιλ Μπάνφιλντ.

Είχε προηγηθεί τον Ιούνιο του 2022 δέσμευση 11 εκατομμυρίων δολαρίων από το Chan Zuckerberg Initiative για έρευνα σχετικά με το πώς η γονιδιακή επεξεργασία θα μπορούσε να ενισχύσει τη δέσμευση και αποθήκευση άνθρακα από φυτά και μικροοργανισμούς του εδάφους.

Άλλες ερευνητικές πρωτοβουλίες περιλάμβαναν:

• Επεξεργασία γονιδίων μικροβιώματος. (Μπορείτε να διαβάσετε περισσότερα σχετικά με εταιρείες μικροβιώματος στο αφιερωμένο μας άρθρο)
• Βελτίωση της αντοχής του ρυζιού στην ξηρασία.
• Μελέτη RNA βακτηριοφάγων και των πρωτεϊνών τους για νέους τρόπους αντιμετώπισης βακτηρίων ανθεκτικών στα αντιβιοτικά. (Μπορείτε να διαβάσετε περισσότερα για εταιρείες βακτηριοφάγων στο αφιερωμένο μας άρθρο)
• Βελτίωση της φωτοσύνθεσης.
• Στοχευμένη αποδόμηση RNA με CRISPR-Csm, διαφορετική προσέγγιση από την παρεμβολή RNA
• Γενετικές τεχνικές για τον έλεγχο κουνουπιών που μεταδίδουν ασθένειες.

Πηγή: Innovative Genomics Institute

Αυτά τα πεδία δείχνουν πιθανές εφαρμογές της γονιδιωματικής τεχνολογίας στην ιατρική, τη γεωργία και τις κλιματικές παρεμβάσεις. Πρόκειται για διαφορετικά αναπτυξιακά προγράμματα και όχι για ήδη διαθέσιμα προϊόντα στο σύνολό τους.

Τελικές Σκέψεις

Η Ντούντνα έχει σημαντικό ρόλο στην έρευνα CRISPR και στην ίδρυση ενός δικτύου εταιρειών, ιδρυμάτων και εργαστηρίων. Η πρόοδός τους στηρίζεται επίσης σε πολλούς άλλους ερευνητές, επιχειρηματίες και συνεργάτες.

Αυτή η ιστορική επισκόπηση βοηθά στην κατανόηση των αναπτυξιακών κατευθύνσεων του CRISPR. Άλλες εφαρμογές εξετάζουμε στο «CRISPR Πέρα από την Ανθρώπινη Υγεία: Το Νέο Επενδυτικό Μέτωπο για την Επεξεργασία Γονιδίων».