5 Pinakamahusay na Kumpanya sa Genome Sequencing

Ang rebolusyon sa genomics at multiomics

Nagsimula ang Human Genome Project noong 1990 at naglabas ng halos kumpletong reference sequence ng genome ng tao noong 2003. Humigit-kumulang US$3 bilyon ang orihinal na badyet para sa malawak na programang pananaliksik, hindi lamang sa isang karaniwang pagsusuri ng genome.

Makalipas ang dalawampung taon, ang gastos ng karaniwang genome sequencing ay bumaba sa humigit-kumulang US$600 bawat genome. May mga sistemang inanunsiyo rin na may gastos mula humigit-kumulang US$200 sa ilang kondisyon. Napakalaki ng ibinaba, ngunit hindi direktang maihahambing ang buong badyet ng unang proyekto sa gastos ng isang modernong sequencing run.

Binago nito ang mga posibilidad ng genomics sa medisina. Maaaring mangalap at magsuri ng maraming datos upang suportahan ang panggagamot na isinasaalang-alang ang mga katangiang henetiko ng pasyente.

Nagbibigay ng pagkakataon sa mga sequencing company ang lumalawak na paggamit ng genomics, mula nutrisyon at pag-aaral ng pagtanda hanggang maagang pagtuklas ng kanser. Inilalarawan ng sumusunod na pagpili ang mga kumpanya at inaasahan mula sa pananaw noong 2023.

Sinusuportahan din ng sequencing ang iba’t ibang larangan ng pananaliksik:

• Metagenomics: pagsusuri sa materyal na henetiko ng mga mikroorganismo sa pinaghalong sample, gaya ng mga mikrobyo sa bituka na nakaaapekto sa kalusugan.
• Transcriptomics& Epigenetics: pinag-aaralan ng transcriptomics ang mga RNA na naipapahayag, samantalang kabilang sa epigenetics ang regulasyon ng gene nang hindi binabago ang pagkakasunod ng DNA. Tumutulong ang mga ito na maunawaan kung paano ginagamit ang planong henetiko, kabilang sa mga sakit at suliranin sa metabolismo.
• Agrigenomics: paggamit ng genomics upang mapabuti ang ani sa agrikultura at produktibidad ng mga hayop sa bukid.
• Pag-aaral ng ekolohiya: pagtatasa sa kalusugan ng mga ecosystem at sa kanilang pagkakaiba-ibang henetiko.
• Sintetikong biyolohiya: pagdisenyo ng bagong gene, katangian, o organismo para sa tiyak na layunin, gaya ng bakteryang sumisira sa plastik o algang gumagawa ng biofuel.

Pinagmulan: PacBio

5 Pinakamahusay na Kumpanya sa Genome Sequencing / Mga Stock

Tinutukoy rito ang limang kumpanyang nakalista sa stock exchange noong 2023 at may negosyo sa sequencing o kaugnay na pagsusuring molekular. Hindi kasama ang pribadong Ultima Genomics o ang kumpanyang Tsino na MGI, na nakalista na sa Shanghai Stock Exchange mula Setyembre 2022. 

1. Illumina, Inc.

Isa ang Illumina sa pinakamalaki at pinakamatatag na supplier ng genomics noong 2023. US$4.55 bilyon ang taunang revenue ng Core Illumina noong 2022, mula US$2.75 bilyon noong 2017, o humigit-kumulang 11% karaniwang paglago bawat taon. US$1.18 bilyon naman ang pinagsamang revenue sa ikalawang quarter ng 2023.

Pinagmulan: Illumina

Kumikita ang Illumina sa mga sequencing instrument at lalo na sa mga materyales na nauubos sa paggamit nito. Maaaring tumaas ang bentahan ng consumable bawat instrumento habang tumataas ang paggamit.

Nagpadala ang Illumina ng 109 NovaSeq X instrument sa ikalawang quarter ng 2023 at itinaas ang kapasidad nitong maghatid para sa taon sa mahigit 390 sistema. Layunin ng paglulunsad na suportahan ang malawakang sequencing at multiomics, kabilang ang pagsusuri sa isang selula at spatial biology.

Bahagi rin ng kasaysayan ng Illumina ang liquid biopsy: pagsusuri sa materyal sa dugo na maaaring may kaugnayan sa kanser. Binuo ng kumpanya ang negosyong ito at inihiwalay bilang GRAIL.

Noong ikalawang quarter ng 2023, iniulat ng GRAIL ang mahigit 7,500 tagapagbigay ng serbisyong pangkalusugan sa US na nagrereseta ng Galleri at 100,000 naisagawang komersiyal na test. Sa hiwalay na pag-aaral gamit ang methylation platform ng GRAIL, nakita ang kanser sa 92% ng 428 blood sample mula sa mga pasyenteng may anim na uri ng kanser sa dugo, pangunahin ay bumalik na sakit o hindi tumutugon sa paggamot. Para sa pag-aaral na iyon ang porsiyento, hindi sa kakayahan ng Galleri na hulaan ang lahat ng pagbalik ng kanser.

Muling binili ng Illumina ang GRAIL noong 2021 sa mas mataas na valuation.

Nagdulot ito ng mga usapin sa kompetisyon sa US at EU dahil nagsusuplay ang Illumina ng sequencing equipment sa ilang kakompetensya ng GRAIL.

Nagpataw ang European Commission noong 2023 ng multang €432 milyon dahil isinara ang transaksiyon bago makuha ang pag-apruba. Umapela ang Illumina. Noong Oktubre 2023, sinabi ng kumpanya: “Ilalabas ng Illumina sa pagmamay-ari nito ang GRAIL sa loob ng isang taon kung hindi ito mananalo sa kaso sa hukuman ng EU.”

Pinagmulan: Illumina

Nagdulot din ng mga tanong ang mga kondisyon ng paghihiwalay ng GRAIL, pangangalap nito ng kapital, at muling pagbili.

Pinuna ng aktibistang mamumuhunang si Carl Icahn ang lupon ng kumpanya at naglahad ng mga paratang tungkol sa posibleng salungatan ng interes at pinsala sa mga shareholder. Noong Hulyo 2023, ibinunyag ng Illumina ang imbestigasyon ng SEC tungkol sa pagkuha sa GRAIL, mga pahayag at pagsisiwalat, at asal at bayad ng ilang pinuno. Ang mga paratang at imbestigasyon ay hindi paghatol na may kasalanan.

Pagsapit ng taglagas ng 2023, umalis na ang CEO, nagbitiw ang isa pang direktor, at nagtalaga ng apat na bagong kasapi sa lupon. Naglabas din ang Illumina ng “Stewardship-Focused Update”. Tinalakay rin ang mga hinala at paratang noon sa serye ng mga artikulo ng Non-GAAP investing.

Ayon sa larawan ng merkado sa artikulo noong 2023, bumaba nang halos 80% ang presyo ng stock mula sa rurok noong Hulyo 2021, pabalik sa halos antas ng 2013.

Malaking dagok sa pamamahala at pananalapi ng isang matatag na kumpanya ang mga pangyayari. Nagbangon ang mga ito ng mga tanong tungkol sa orihinal na paghihiwalay at muling pagbili sa GRAIL.

Para sa mga mamumuhunan noong 2023, mahalagang suriin ang epekto ng kampanya ni Icahn, pagbuti ng pamamahala, at kung gaano karami sa mga panganib ang nakapaloob na sa presyo ng stock.

2. 10x Genomics, Inc.

Ang 10x Genomics (TXG ) ay gumagawa ng mga kasangkapan para sa pagsusuri ng isang selula at spatial biology. Nasusuri ang aktibidad ng gene at ibang katangiang molekular at, sa spatial analysis, napapanatili ang impormasyon tungkol sa lokasyon sa tissue.

Itinatag ang kumpanya noong 2012, kasama si Serge Saxonov, na dati nang namuno sa research and development ng personal genetic testing company na 23andMe.

Pinagsama ng 10x Genomics ang sariling research and development at mga acquisition. Binanggit ng presentasyon ng kumpanya ang mahigit US$1 bilyong pinagsama-samang pamumuhunan sa R&D. Nakatulong sa pagbuo ng Visium ang pagbili sa Spatial Transcriptomics noong 2018.

Pinagmulan: 10x Genomics: talaan ng mga acquisition ng 10x Genomics ayon sa panahon

Nagdala ang pagkuha sa ReadCoor at Cartana noong 2020 ng teknolohiya para sa Xenium platform, na higit pang binuo ng 10x at inilunsad noong 2022.

Ipinakilala ng kumpanya ang Chromium platform noong 2016 at pinalawak ito gamit ang seryeng Chromium X noong 2021.

Matapos bilhin ang Tetramer Shop noong 2021, ipinakilala rin ng 10x Genomics ang BEAM (Barcode Enabled Antigen Mapping) noong 2022. Tinutulungan nitong pag-aralan kung paano kinikilala ng mga immune cell ang antigen, na mahalaga sa pagsasaliksik sa imyunidad at sakit.

Tumaas nang 17% ang revenue sa ikalawang quarter ng 2023 kumpara sa nakaraang taon. Nakatulong ang paglulunsad ng Xenium, at lumampas sa 100 ang naihatid na Xenium system noong Agosto 2023.

Noong Setyembre 2023, nakakuha ang 10x Genomics ng pansamantalang utos laban sa kakompetensyang NanoString mula sa Unified Patent Court (UPC). Saklaw nito ang mga produktong CosMx para sa RNA detection sa 17 kalahok na bansa ng EU, hindi lahat ng produkto sa buong EU. Patuloy pa ang kaso.

Noong 2023, ang spatial biology ay pangunahing larangan ng akademiko at batayang pananaliksik. Maaaring mapalawak ng pag-unlad ang klinikal na pakinabang nito, ngunit hindi tiyak na magiging karaniwang medikal na test. Makasuporta rin sa benta ng consumable ang mas maraming naka-install na instrumento.

3. Oxford Nanopore Technologies plc (ONT.L)

Ang Oxford Nanopore ay gumagamit ng isang teknik kung saan dumaraan ang DNA o RNA sa mga nanopore ng isang flow cell. Nagbibigay ng impormasyon tungkol sa molekula ang mga pagbabago sa kuryente, at ginagamit ang mga ito upang matukoy ang sequence.Maaaring iproseso ang mga sukat habang tumatakbo ang instrumento upang maging available ang sequence data sa real time.

Pinagmulan: Oxford Nanopore

Isang bentahe ang pagbasa ng mahahabang fragment ng DNA, bukod sa ibang haba ng pagbasa. Makakatulong ang mahabang read at mabilis na pagproseso sa pananaliksik sa kanser, mga impeksiyon, at resistansiya sa antibiotic.

Nagbibigay-daan din ang electrical detection sa maliliit at nabibitbit na sequencer. Noong 2023, may instrumento at starter package ang Oxford Nanopore mula humigit-kumulang US$1,000, bukod sa mas malalaking sistema. Sinusuportahan nito ang gawaing panlabas at maliliit na eksperimento.

Ayon sa presentasyon ng kumpanya, lumago ang revenue ng Life Science Research Tools (LSRT) nang karaniwang 46% bawat taon noong 2018–2022. Sa labindalawang buwan hanggang Hunyo 30, 2023, may mahigit 7,300 aktibong direktang customer account, isang netong dagdag na mahigit 640 sa panahong iyon.

Pinagmulan: Oxford Nanopore

Mula sa pananaw noong 2023, hindi pa tiyak ang magiging puwesto ng Oxford Nanopore sa mas ganap na merkado ng sequencing.

Maaaring makipagkumpitensya ang teknolohiya sa ilang gamit laban sa mga matatag na pamamaraang may kemikal at optikal na detection.

May pagkakataon din sa mga nabibitbit na sistema, maliit na bilang ng sample, at pagsusuring nangangailangan ng mahabang read.

Pinag-aaralan din ng kumpanya ang mga protina, pagbabago sa mga ito pagkatapos ng translasyon, maliliit na molekula, at iba pang katangiang molekular.

4. Pacific Biosciences of California, Inc.

Itinatag ang PacBio ilang taon pagkatapos ng Illumina at nanatiling mas maliit na kumpanya ng sequencing, na nakatuon din sa mahahabang read na may mataas na katumpakan.

PacBio ay bumili sa Omniome noong 2021, na nagdagdag ng short-read sequencing by binding (SBB) sa dati nitong long-read technology. Sumunod ang acquisition sa Apton na inanunsiyo noong Agosto 2023, na nagkakahalaga ng hanggang US$110 milyon. Gumagawa ang Apton ng high-throughput short-read technology. Kasama sa kasunduan ang humigit-kumulang US$85 milyon sa simula at hanggang US$25 milyon kapag naabot ang isang revenue milestone.

Pinagmulan: PacBio

Mga Onso system ng PacBio ang nagsimulang ihatid sa customer noong Agosto 2023. Inilarawan ng kumpanya ang paglulunsad bilang “pinakamagandang simula sa kasaysayan ng PacBio”. Para sa short read ang Onso. Gumamit ang Revio ng HiFi para sa long read, na may sinabing kapasidad na hanggang humigit-kumulang 1,300 genome ng tao bawat taon sa 30× coverage. Hiwalay na binubuo ng PacBio ang high-throughput short-read system batay sa SBB at teknolohiya ng Apton.

Inaasahan ng PacBio na mas mabilis lalago ang long-read sequencing kaysa sa mas malawak na next-generation sequencing market. Sa isang paghahambing na ipinakita nito, sinabing humigit-kumulang sampung beses na mas tumpak ang HiFi kaysa sa ibang long-read method na sinubok.

Pinagmulan: PacBio

Nakadepende rin sa karagdagang pagsusuri ang kabuuang gastos. Sa isang diagnostikong halimbawang ipinakita ng PacBio, US$500 ang short-read sequencing ngunit maaaring umabot nang lampas US$1,500 ang kabuuan dahil sa dagdag na mga test.

Kaya itinuring ng ekspertong sinipi sa presentasyon na kaakit-akit ang US$950 na Revio genome para sa gayong diagnostikong gamit. Isa itong partikular na halimbawa, hindi pangkalahatang presyo ng buong proseso ng diagnosis.

Nakakita ang PacBio ng pagkakataon sa tumpak na long read. Tinataya ng pamunuan noon na maaaring tumaas ang sariling market penetration noong 2022–2026 mula mas mababa sa 5% tungong mas mababa sa 10% sa human genomics, at mula mas mababa sa 1% tungong mas mababa sa 5% sa oncology.

Bukod sa Illumina, mahalagang posibleng kakompetensya ang Oxford Nanopore sa long-read methods at medikal na pananaliksik.

Isang matatag nang mas maliit na kakompetensya ang PacBio, hindi bagong startup. Ayon sa pagsusuri noong 2023, makakatulong ang mas malakas na posisyon sa mga espesyalisadong gamit upang maiba ito sa mas malalaking karibal.

5. NanoString Technologies, Inc.

Itinatag ang NanoString noong 2003 upang paunlarin ang digital molecular barcoding batay sa teknolohiya ng Institute for Systems Biology sa Seattle.

Pinagmulan: NanoString

Pagdating ng 2008, inilunsad nito ang unang produkto, nCounter, para sa pagsusuri ng gene expression. Naging pundasyon ito ng sumunod na pag-unlad. Dumating noong 2019 ang GeoMx, sinundan ng CosMx at ang digital platform na AtoMx.

GeoMx ay sumusuri sa RNA expression at mga protein target sa tissue habang pinananatili ang lokasyon. Mahigit 150 protina ang mga panel na tinalakay noong 2023; nakadepende sa uri ng pagsusuri at panel ang paghahambing sa Xenium.CosMx Spatial Molecular Imager (SMI) ay nagmamapa ng RNA at protina sa antas ng isang selula sa tissue. Binanggit ng artikulo noon ang 64 protein target at posibleng pagpapalawak sa 120 sa 2024.

Pinagmulan: NanoString

Nakatulong ang NanoString sa pagdami ng mga publikasyon tungkol sa pagsusuring molekular at spatial biology.Ang 7,117 publikasyong binanggit sa artikulo ay gumamit ng teknolohiya ng NanoString sa mga larangang gaya ng kanser, mga impeksiyon kabilang ang COVID-19, immunology, agrikultura, at neurology.

Noong 2023, kasangkot ang NanoString sa malaking usaping patente sa 10x Genomics.Ang pansamantalang utos ng UPC noong Setyembre 2023 ay naglimita sa benta ng mga produktong CosMx para sa RNA detection sa mga kalahok na bansa ng EU. Tinataya ng NanoString na mas mababa sa 10% ng nakabinbing order ng CosMx instrument noon ang para sa mga bansang iyon, at umapela ito. Mahalaga ang usapin sa kumpanyang may negatibong cash flow.

Makikita sa larawan ng merkado sa artikulo noong 2023 ang pag-aalala sa pananalapi ng NanoString: mas mababa sa US$2 ang stock, kumpara sa US$79 na rurok noong 2021 na binanggit ng artikulo. US$10 bawat share ang presyo ng IPO noong 2013.

Kailangang tasahin noon ng mga mamumuhunan ang layunin ng pamunuan na maging kumikita pagsapit ng 2025. Isa itong pagtataya. Iniulat ng NanoString na ang paggamit ng cash sa ikatlong quarter ng 2023 ay bumaba nang halos 50% kumpara sa naunang quarter.