Biotech
5 Pinakamahusay na Kumpanya sa Genome Sequencing

Ang Rebolusyon sa Genomics at Multi-omic
Ang unang pag-decode ng human genome ay nagsimula noong 1990 at unang natamo noong 2003. Ito ay nagkakahalaga ng nakabiglang $3B.
Mabilis na umusad ng 20 taon at ang gastos sa genome sequencing ay bumaba sa $600/genome. O isang 5,000,000x na pagbawas sa gastos! At maaari pang bumaba sa kasing baba ng $200.
Ganap nitong binago ang paraan ng ating paglapit sa genomics mula sa medikal na perspektibo. Pinapayagan nito ang napakalaking dami ng datos na malikha at ma-analisa at para sa bawat tao ay maaaring magkaroon ng access sa advanced na personalized na medisina na tumutugma sa kanyang natatanging genetic makeup.
Sa pagiging pangunahing medikal na kaginhawaan ng genomics, makikinabang ang mga kumpanya ng genome sequencing mula sa mabilis na lumalaking merkado at maraming aplikasyon, mula sa nutrisyon at pag-iwas sa pagtanda hanggang sa maagang pagtuklas ng kanser.
At hindi pa ito lahat. Ang parehong teknolohiya na ginamit para sa sequencing ng DNA ng genome ay maaari ring magamit upang lumikha ng buong bagong mga larangan ng agham:
- Metagenomics: sequencing ng genome ng mga bakterya na nakatira sa ating bituka at malaki ang epekto sa ating kalusugan.
- Transcriptomes & Epigenetics: kung ang genome ay blueprint, ang transcriptomes ay kung paano ginagamit ang blueprint sa praktika at sa real-time. Malamang na magiging napakahalaga ito para lutasin ang maraming hindi magagamot na sakit at metabolic na problema.
- Agrigenomics: paggamit ng genomics upang mapabuti ang ani sa agrikultura at produktibidad ng mga hayop sa bukid.
- Ecological studies: tumpak na pagsusuri ng kalusugan ng isang ekosistema at genetic diversity.
- Synthetic Biology: Ang paglikha ng mga bagong gene, katangian, o buong organismo na may tiyak na layunin: halimbawa, bakterya na kumakain ng plastik o algae na gumagawa ng biofuel.

Pinagmulan: PacBio
5 Pinakamahusay na Kumpanya sa Genome Sequencing / Mga Stock
Ang artikulong ito ay sumasaklaw sa 5 pinakamahusay na publicly traded na kumpanya ng genome sequencing. Hindi nito saklaw ang mga kapantay na mahalaga ngunit privately listed na kumpanya tulad ng Ultima Genomics o Chinese MGI.
1. Illumina, Inc.
(ILMN )
Ang Illumina ay nangungunang kumpanya sa genomics, nangunguna bilang pinakamalaki at pinaka-establisado sa industriya, na may $1.2B na kita, na lumago ng 11% CAGR sa nakaraang 5 taon.

Pinagmulan: Illumina
Katulad ng karamihan ng mga kumpanya ng genome sequencing, kumikita ang Illumina sa pagbebenta ng mga sequencer, ngunit higit sa lahat sa pagbebenta ng mga consumable na ginagamit ng mga sequencer, kung saan ang kita bawat makina ay karaniwang lumalaki sa paglipas ng panahon habang ito ay patuloy na ginagamit sa full-time capacity.
Ang bagong modelo ng genome sequencer ng kumpanya, NovaSeqX, ay isang tagumpay, na may 109 na shipment sa Q2 2023 at inaasahang 390 na shipment para sa 2023. Pinabilis nito ang pag-aampon ng mass genome sequencing sa mga kliyente ng Illumina na may mas maraming multi-omics analyses (pagsasama ng maraming “-omics” na teknik) at mas malaking saklaw para sa single cell at spatial analyses.
Kapag tinatalakay ang Illumina, kinakailangan ng mahabang paliwanag para sa isang bagong aplikasyon ng genomics, ang pagtuklas ng kanser sa isang sample ng dugo na tinatawag na liquid biopsy. Nagtatrabaho ang Illumina sa teknolohiyang ito at pagkatapos ay inilabas ito bilang isang kumpanya na tinatawag na Grail.
Ang Grail ay napaka matagumpay mula sa teknikal at komersyal na pananaw, na may 7,500 na provider na nagrerekomenda ng mga test ng Grail at naabot ang milestone na 100,000 na test na naisagawa sa Q2 2023. Nakadetect din ito ng 92% ng cancer relapse sa 6 na iba’t ibang blood cancers.
Ilang taon pagkatapos, muling nakuha ng Illumina ang kumpanyang ito sa mas mataas na presyo.
Nagdulot ito ng ilang problema. Una, ang mga regulatory authority sa USA at EU ay nagtaas ng alalahanin tungkol sa panganib ng monopolyo, kung saan ang Illumina ay supplier ng mga genome sequencing machine sa maraming kakompetensya ng Grail.
Nagresulta ito sa €432M na multa mula sa EU. Kung ang hatol na ito na nagbabawal sa acquisition ay hindi maresolba, “Ilalako ng Illumina ang Grail sa loob ng isang taon kung hindi ito manalo sa hamon sa hukuman ng EU.”

Pinagmulan: Illumina
Isa pang hanay ng mga problema ay nagmula sa mga kondisyon ng mamahaling spin-off ng Grail, pagtaas ng pondo, at muling pagsasama sa Illumina.
Inisyatibo na mamumuhunan na si Carl Icahn ay inatake ang board ng kumpanya at nagmumungkahi na posibleng hindi tapat o mapanirang pakikipagtransaksyon ang ginawa pabor sa mga insider laban sa interes ng mga shareholders ng kumpanya. Iniimbestigahan din ito ng SEC.
Sa ngayon, napalitan na ang CEO, isang board member ang umalis, 4 na bagong board members ang naitalaga, at naglathala ang Illumina ng “Stewardship-Focused Update“. Maaari mo ring basahin ang higit pa tungkol sa mga hinala at paratang na ito sa serye ng mga artikulo ng Non-GAAP investing.
Ang stock ng kumpanya ay bumagsak nang matindi mula sa pinakamataas nito noong Hulyo 2021 ng halos 80%, bumalik sa antas ng 2013.
Ito ay isang nakakabiglang sitwasyon para sa isang malaking at establisadong kumpanya tulad ng Illumina, gaano man katotoo ang mga paratang, dahil ito ay nagpapakita ng kahinaan sa desisyon ng pamunuan na ilako ang Grail sa simula. Sa pinakamababa, napatunayan itong isang magastos na pagkakamali.
Nais ng mga mamumuhunan na tasahin kung handa na silang sumama kay Carl Icahn, isang maalamat at kontrobersyal na activist investor na may kahanga-hangang track record. At kung ang mahinang pamamahala ng nakaraang ilang taon ay ganap nang naipakita sa presyo, at maaaring labis na nakasira sa valuasyon ng kumpanya.
2. 10x Genomics, Inc.
(TXG )
Ang 10x Genomics ay nangunguna sa spatial biology, na nag-aaral ng genome at transcriptome sa 3D, na nagpapahintulot ng visualisasyon ng aktibidad ng mga gene sa antas ng selula o kahit sa loob ng selula.
Itinatag ang kumpanya noong 2012, kasama si Serge Saxonov sa mga tagapagtatag, na direktor ng R&D ng personalized genome testing company na 23andMe.
Lumago ang 10x Genomics gamit ang kombinasyon ng R&D (mahigit $1B na ininvest sa R&D hanggang ngayon) at mga acquisition. Kapansin-pansin, nakuha ang Visium platform sa pamamagitan ng acquisition ng Spatial Transcriptomics noong 2018.

Pinagmulan: 10x Genomics: 10x Genomics acquisitions timeline
Ganito rin nakuha ng 10x Genomics ang Xenium platform sa pamamagitan ng pag-acquire ng Readcoor at Cartana noong 2020.
Noong 2020, inilunsad din nito ang the Chromium platform, na in-update noong sumunod na taon sa Chromium X.
Sa pamamagitan ng acquisition ng Tetramer Shop noong 2021, inilunsad din ng 10x Genomics ang BEAM (Barcode Enabled Antigen Mapping) noong 2022. Pinapayagan nito ang mga mananaliksik na tukuyin nang detalyado ang mga bahagi ng immune system. Maaaring ito ay napaka-impluwensyal sa pananaliksik sa immunity at mga bagong sakit.
Lumago ang kita ng 17% taon-taon sa Q2 2023, pinangunahan ng benta ng Xenium, na naabot ang milestone na 100 unit na naibenta noong Agosto 2023.
Nakuha din ng kumpanya noong Setyembre 2023 ang isang kritikal na tagumpay laban sa pangunahing kakompetensya nito, ang Nanostring. Sa ngayon, ipinagbabawal ang Nanostring na magbenta ng kanilang CosMx Spatial Molecular Imager (SMI) instruments sa karamihan ng EU dahil sa paglabag sa mga patente ng 10x Genomics.
Ang kumpanya ay nasa maagang yugto pa, medyo kahalintulad ng mga unang araw ng Illumina. Sa ngayon, ang spatial biology ay limitado sa mundo ng akademiko at pundamental na pananaliksik. Ngunit tulad ng maraming biotechnologies, maaaring balang araw ito ay maging laganap, unti-unting maging medikal na kasangkapan, at pagkatapos ay maging isang “routine” na pagsusuri. Sa anumang kaso, ang lumalaking bilang ng mga naka-install na makina ay dapat magtulak ng benta ng consumables at paglago ng kita.
3. Oxford Nanopore Technologies plc (ONT.L)
Ang Oxford Nanopore ay gumagamit ng isang natatanging teknolohiya sa genome sequencing na umaasa sa mga flow cell. Pinapayagan nito ang DNA na “basahin” kapag tumatawid sa mga nanopore, hindi sa pamamagitan ng kemikal kundi direkta sa pamamagitan ng pagsukat ng electric current. Sa ganitong paraan, ito ang unang pagkakataon na ang isang computer ay makakabasa ng genetic sequence (DNA & RNA) nang real-time.

Pinagmulan: Oxford Nanopore
Isa pang natatanging bentahe ng teknolohiya ng kumpanya ay ang kakayahang magbasa ng mas mahabang genetic sequences kaysa sa tradisyunal na mga pamamaraan ng sequencing. Ang mahahabang sequences at real-time na pagbasa ay makakatulong upang makakuha ng mas maganda at mas mabilis na resulta, na mahalaga para sa pagsusuri ng kanser o mga nakakahawang sakit tulad ng antibiotic-resistant bacteria.
Sa huli, ang electrical measurement ay nagpapahintulot ng mas maliit at mas portable na mga sequencer, isang pagpapabuti sa napakalaking mga makina na ginagamit noon. Dahil dito, maaaring gumawa ang kumpanya ng malawak na hanay ng mga sequencer, kabilang ang mas mabagal, mas maliit, at mas murang mga makina, na nagsisimula sa $1,000. Maaaring ganap nitong palawakin ang merkado ng sequencing, kung saan ang mobile o mababang-gastos na sequencing ay hindi dating isang opsyon.
Lumago ang kita ng Oxford Nanopore ng 46% CAGR sa nakaraang 4 na taon, salamat sa 7,300 na customer sa Q2 2023, kung saan 640 ang nakuha sa nakaraang 12 buwan.

Pinagmulan: Oxford Nanopore
Dahil sa radikal nitong bagong teknolohiya, hindi malinaw kung saan magtatagpo ang Oxford sa mas mature na ecosystem ng genome sequencing.
Maaaring ganap nitong palitan ang umiiral na teknolohiya ng chemical/optical na pagbabasa ng mga genome.
O maaari itong maging matagumpay ngunit niche na aplikasyon para sa low-volume o mobile sequencing o para sa sequencing na nangangailangan ng mataas na katumpakan sa pagbabasa ng mahahabang genetic sequences.
Plano rin ng kumpanya na palawakin ang pagbasa ng mga protina, post-translational modification ng mga protina o maliliit na molekula, at iba pang sukat sa pinakakatimog ng life sciences.
4. Pacific Biosciences of California, Inc.
(PACB )
Nagsimula ilang taon pagkatapos ng Illumina, ang PacBio ay naging mas maliit na manlalaro sa genome sequencing mula noon. Sa kabila ng mas maliit nitong sukat, ang kagamitan ng kumpanya ay nanatiling nasa pinakamataas na antas ng performance.
PacBio kamakailan ay nakuha ang Omniome noong 2021, na nagbigay dito ng bentahe sa katumpakan sa pagbabasa ng napakahaba o maikling genetic sequences. Ang bentahe na ito ay pinagtibay pa ng kalaunan na acquisition ng Apton para sa $110M noong Agosto 2023, na nag-specialize rin sa short read, high throughput (SR-HI).

Pinagmulan: PacBio
PacBio’s Onso systems ay nagsisimula nang ipadala sa mga customer, at ang paglulunsad nito ay inilarawan ng kumpanya bilang “pinakamagandang simula sa kasaysayan ng PacBio”. Magiging espesyalista ito sa short sequences, habang ang Revio HiFi System nito ay makakabasa ng long sequences at magtatrabaho 24/7, na makakabasa ng 1,300 buong human genome bawat taon (tinatayang 4/araw). Pagkatapos, ang Revio HiFi ay papalitan ng HT SBB system, na malamang na iintegrate ang teknolohiya ng Apton.
Inaasahan ng PacBio na ang long sequences ay lalago nang mas mabilis kaysa sa mas malawak na merkado ng NGS at inaangkin na ang mga sistema nito ay 10x na mas tumpak kaysa sa kompetisyon.

Pinagmulan: PacBio
Kagiliw-liwan, maaari rin nitong pababain ang kabuuang gastos ng genome sequencing. Ang short sequences ay kailangang muling buuin sa isang komprehensibong kabuuan nang hindi nagiging masyadong teknikal. Kaya ang $500 na short read genome ay maaaring agad mangailangan ng karagdagang pagsusuri na nagkakahalaga ng karagdagang $1000 upang maging tunay na kapaki-pakinabang bilang diagnostic tool.
Kaya ang $950 na Revio long sequence analysis, na mas tumpak, ay iniiwasan ang hakbang na ito at nagiging mas mura para sa diagnostic na aplikasyon.
Ang pokus ng PacBio sa high-precision/long-sequence analysis ay dapat magbigay dito ng kalamangan sa diagnostics sa susunod na ilang taon. Naniniwala ang pamunuan ng PacBio na ito ay maaaring itaas ang market penetration ng kumpanya sa human genomics mula 5% hanggang 10% at sa oncology (kanser) mula 1% hanggang 5%.
Habang ang PacBio ay pangunahing nakatuon sa dekada-dalawang kompetisyon nito sa Illumina, maaaring kailanganin din nitong harapin ang Oxford Nanopore sa diagnostic/long-sequence market.
Sa kasaysayan ng pagiging mas maliit na kakompetensya ng Illumina, ang PacBio ay medyo underdog sa larangan at hindi isang bagong “exciting” na startup. Hindi ito nangangahulugang hindi ito kompetitibo, at kung magtatagumpay ito sa pagkuha ng niche market na kasalukuyang pinagtutuunan nito, maaaring positibong sorpresahin nito ang merkado sa pamamagitan ng pag-iba mula sa historikal nitong kakompetensya.
5. NanoString Technologies, Inc.
(NSTG )
Inilunsad ang NanoString noong 2003 upang magamit ang digital molecular barcoding technology na inimbento sa Seattle Institute for Systems Biology.

Pinagmulan: NanoString
Pagdating ng 2008, inilunsad nito ang unang produkto, nCounter, na isang malaking pag-unlad sa transcriptomics (pag-aaral ng mRNA). Ang nCounter ay nagdala sa kumpanya pasulong habang ito ay nag-develop ng mga susunod na hakbang. Noong 2019, inilunsad nito ang GeoMx, sinundan ng CosMx at ang digital platform na AtoMX.
GeoMx ay dinisenyo upang pag-aralan ang RNA expression sa buong tisyu at maaari ring mag-analyze ng 150+ na protina, mas maraming target kaysa sa Xenium ng 10x. CosMx Single Molecular Imager (SMI) naman ay maaaring tumingin sa isang solong selula at kung ano ang nangyayari sa loob para sa RNA at hanggang 64 na protein target, at posibleng umabot hanggang 120 sa 2024.

Pinagmulan: NanoString
Ang NanoString ay naging instrumental sa pagdami ng mga siyentipikong publikasyon na gumagamit ng spatial biology. Hindi bababa sa 7,117 na publikasyon ang nagbanggit ng mga makina ng NanoString mula sa iba’t ibang larangan tulad ng pananaliksik sa kanser, nakakahawang sakit (kasama ang COVID-19), immunology, agrikultura, o neurology.
Ang NanoString ay kasangkot sa isang mapait na legal na labanan sa 10x Genomics. Ang kamakailang kautusan ng hukuman mula sa EU patent regulator ay makakaapekto sa 10% ng NanoString kung hindi manalo ang kumpanya sa apela nito. Kaya, bagaman hindi ito isang death blow, ito ay masamang balita pa rin para sa isang batang kumpanya na may negatibong cash flow.
Ang mga merkado ay malinaw na nag-aalala tungkol sa pangmatagalang kakayahang mabuhay ng NanoString, na ang stock ay nasa ibaba ng $2/share, bumaba mula sa pinakamataas na $79 noong 2021, at ang presyo ng IPO nito na $9.1/share noong 2013.
Nais ng mga mamumuhunan na tasahin ang mga plano ng kumpanya na maabot ang profitability sa 2025 at tukuyin kung ang pagbaba ng presyo ay labis at kumakatawan sa isang pagkakataon, isinasaalang-alang na ang kumpanya ay nabawasan ang cash burn ng 50% sa Q3 2023.











